source: sasview/sansmodels/src/sans/models/RPA10Model.py @ 73c200a

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 73c200a was 339ce67, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 14 years ago

added some models and tests

  • Property mode set to 100644
File size: 9.6 KB
Line 
1   
2from sans.models.BaseComponent import BaseComponent
3from sans.models.RPAModel import RPAModel
4from copy import deepcopy
5max_case_n = 10
6class RPA10Model(BaseComponent):
7    """
8    This multi-model is based on Parratt formalism and provides the capability
9    of changing the number of layers between 0 and 10.
10    """
11    def __init__(self, multfactor=1):
12        BaseComponent.__init__(self)
13        """
14        :param multfactor: number of cases in the model, assumes 0<= case# <=10.
15        """
16
17        ## Setting  model name model description
18        self.description=""
19        model = RPAModel()
20        self.model = model
21        self.name = "RPA10Model"
22        self.description=model.description
23        self.case_num = multfactor
24        ## Define parameters
25        self.params = {}
26
27        ## Parameter details [units, min, max]
28        self.details = {}
29       
30        # non-fittable parameters
31        self.non_fittable = model.non_fittable
32
33        # list of function in order of the function number
34        self.fun_list = self._get_func_list()
35        ## dispersion
36        self._set_dispersion()
37        ## Define parameters
38        self._set_params()
39       
40        ## Parameter details [units, min, max]
41        self._set_details()
42       
43        #list of parameter that can be fitted
44        self._set_fixed_params() 
45        self.model.params['lcase_n'] = self.case_num
46       
47        ## functional multiplicity of the model
48        self.multiplicity_info = [max_case_n,"Case No.:",["C/D Binary Mixture of Homopolymers",
49                                                         "C-D Diblock Copolymer",
50                                                         "B/C/D Ternary Mixture of Homopolymers",
51                                                         "B/C-D Mixture of Homopolymer B and Diblock Copolymer C-D",
52                                                         "B-C-D Triblock Copolymer",
53                                                         "A/B/C/D Quaternary Mixture of Homopolymers",
54                                                         "A/B/C-D Mixture of Homopolymer A/B and Diblock C-D",
55                                                         "A/B-C-D Mixture of Homopolymer A and triblock B-C-D",
56                                                         "A-B/C-D Mixture of Diblock Copolymer A-B and Diblock C-D",
57                                                         "A-B-C-D Four-block Copolymer"],
58                                                         []]
59   
60    def _clone(self, obj):
61        """
62        Internal utility function to copy the internal
63        data members to a fresh copy.
64        """
65        obj.params     = deepcopy(self.params)
66        obj.non_fittable     = deepcopy(self.non_fittable)
67        obj.description     = deepcopy(self.description)
68        obj.details    = deepcopy(self.details)
69        obj.dispersion = deepcopy(self.dispersion)
70        obj.model  = self.model.clone()
71
72        return obj
73   
74   
75    def _set_dispersion(self):
76        """
77        model dispersions
78        """ 
79        ##set dispersion from model
80        self.dispersion = {}
81                   
82
83    def _set_params(self):
84        """
85        Concatenate the parameters of the model to create
86        this model parameters
87        """
88        # set the case number first
89        self.model.params['lcase_n'] = self.case_num 
90        # rearrange the parameters for the given # of shells
91        for name , value in self.model.params.iteritems():
92            if name == 'lcase_n':
93                continue
94            elif name.lower() == 'scale' or \
95                        name.lower() == 'background':
96                    self.params[name] = value
97            elif self.case_num <= 1:
98                if name.lower() == 'nc' or \
99                        name.lower() == 'phic' or \
100                        name.lower() == 'vc' or \
101                        name.lower() == 'lc' or \
102                        name.lower() == 'bc' or \
103                        name.lower() == 'nd' or \
104                        name.lower() == 'phid' or \
105                        name.lower() == 'vd' or \
106                        name.lower() == 'ld' or \
107                        name.lower() == 'bd' or \
108                        name.lower() == 'kcd':
109                    self.params[name] = value
110            elif self.case_num > 1 and self.case_num <= 4:
111                if name.lower() == 'nb' or \
112                        name.lower() == 'phib' or \
113                        name.lower() == 'vb' or \
114                        name.lower() == 'lb' or \
115                        name.lower() == 'bb' or \
116                        name.lower() == 'nc' or \
117                        name.lower() == 'phic' or \
118                        name.lower() == 'vc' or \
119                        name.lower() == 'lc' or \
120                        name.lower() == 'bc' or \
121                        name.lower() == 'nd' or \
122                        name.lower() == 'phid' or \
123                        name.lower() == 'vd' or \
124                        name.lower() == 'ld' or \
125                        name.lower() == 'bd' or \
126                        name.lower() == 'kbc' or \
127                        name.lower() == 'kbd' or \
128                        name.lower() == 'kcd' :
129                    self.params[name] = value
130            else:
131                if name.lower() == 'na' or \
132                        name.lower() == 'phia' or \
133                        name.lower() == 'va' or \
134                        name.lower() == 'la' or \
135                        name.lower() == 'ba' or \
136                        name.lower() == 'nb' or \
137                        name.lower() == 'phib' or \
138                        name.lower() == 'vb' or \
139                        name.lower() == 'lb' or \
140                        name.lower() == 'bb' or \
141                        name.lower() == 'nc' or \
142                        name.lower() == 'phic' or \
143                        name.lower() == 'vc' or \
144                        name.lower() == 'lc' or \
145                        name.lower() == 'bc' or \
146                        name.lower() == 'nd' or \
147                        name.lower() == 'phid' or \
148                        name.lower() == 'vd' or \
149                        name.lower() == 'ld' or \
150                        name.lower() == 'bd' or \
151                        name.lower() == 'kab' or \
152                        name.lower() == 'kac' or \
153                        name.lower() == 'kad' or \
154                        name.lower() == 'kbc' or \
155                        name.lower() == 'kbd' or \
156                        name.lower() == 'kcd' :
157                    self.params[name] = value
158           
159         
160
161    def _set_details(self):
162        """
163        Concatenate details of the original model to create
164        this model details
165        """
166        for name ,detail in self.model.details.iteritems():
167            if name in self.params.iterkeys():
168                self.details[name]= detail
169   
170    def _get_func_list(self):
171        """
172        Get the list of functions in each cases
173        """
174        func_list = {}
175        return func_list
176       
177    def getProfile(self):
178        """
179        Get SLD profile
180       
181        : return: None, No SLD profile supporting for this model
182        """
183        return None
184       
185    def setParam(self, name, value):
186        """
187        Set the value of a model parameter
188   
189        : param name: name of the parameter
190        : param value: value of the parameter
191        """
192        # set param to new model
193        self._setParamHelper( name, value)
194           
195        self.model.setParam( name, value)
196
197    def _setParamHelper(self, name, value):
198        """
199        Helper function to setParam
200        """
201
202        # Look for standard parameter
203        for item in self.params.keys():
204            if item.lower()==name.lower():
205                self.params[item] = value
206                return
207       
208        raise ValueError, "Model does not contain parameter %s" % name
209             
210   
211    def _set_fixed_params(self):
212        """
213        Fill the self.fixed list with the model fixed list
214        """
215        pass         
216
217    def run(self, x = 0.0):
218        """
219        Evaluate the model
220       
221        :param x: input q, or [q,phi]
222       
223        :return: scattering function P(q)
224       
225        """
226
227        return self.model.run(x)
228
229    def runXY(self, x = 0.0):
230        """
231        Evaluate the model
232       
233        : param x: input q-value (float or [float, float] as [qx, qy])
234        : return: scattering function value
235        """ 
236
237        return self.model.runXY(x)
238   
239    ## Now (May27,10) directly uses the model eval function
240    ## instead of the for-loop in Base Component.
241    def evalDistribution(self, x = []):
242        """
243        Evaluate the model in cartesian coordinates
244       
245        : param x: input q[], or [qx[], qy[]]
246        : return: scattering function P(q[])
247        """
248        # set effective radius and scaling factor before run
249        return self.model.evalDistribution(x)
250    def calculate_ER(self):
251        """
252        """
253        return self.model.calculate_ER()
254    def set_dispersion(self, parameter, dispersion):
255        """
256        Set the dispersion object for a model parameter
257       
258        : param parameter: name of the parameter [string]
259        :dispersion: dispersion object of type DispersionModel
260        """
261        pass
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.