source: sasview/sansmodels/src/sans/models/MultiplicationModel.py @ cad821b

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since cad821b was 3ba03a4c, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 16 years ago

cleaned up mess
  • Property mode set to 100644
File size: 8.6 KB
Line 
1
2from sans.models.BaseComponent import BaseComponent
3import numpy, math
4import copy
5from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
6from sans.models.DiamCylFunc import  DiamCylFunc
7from sans.models.DiamEllipFunc import  DiamEllipFunc
8class MultiplicationModel(BaseComponent):
9    """
10        Use for P(Q)*S(Q); function call maut be in order of P(Q) and then S(Q).
11        Perform multplication of two models.
12        Contains the models parameters combined.
13    """
14    def __init__(self, model1, model2 ):
15        BaseComponent.__init__(self)
16
17       
18        ## Setting  model name model description
19        self.description=""
20        if  model1.name != "NoStructure"and  model2.name != "NoStructure":
21             self.name = model1.name +" * "+ model2.name
22             self.description= self.name+"\n"
23             self.description +="see %s description and %s description"%( model1.name,
24                                                                         model2.name )
25        elif  model2.name != "NoStructure":
26            self.name = model2.name
27            self.description= model2.description
28        else :
29            self.name = model1.name
30            self.description= model1.description
31                       
32        #For virial coefficients for only two P(Q) models,"CylinderModel","EllipsoidModel". SphereModel works w/o it.
33        modelDiam = None
34        if model1.__class__.__name__ == "CylinderModel":
35            Model1DPlugin("DiamCylFunc")
36            modelDiam = DiamCylFunc()
37            para1 = 'radius'
38            para2 = 'length'
39           
40        elif model1.__class__.__name__  == "EllipsoidModel":
41            Model1DPlugin("DiamEllipFunc")
42            modelDiam = DiamEllipFunc()
43            para1 = 'radius_a'
44            para2 = 'radius_b'
45           
46        self.modelD = modelDiam
47       
48        if model1.__class__.__name__ == "CylinderModel" \
49            or model1.__class__.__name__  == "EllipsoidModel":
50         
51            self.para1 = para1
52            self.para2 = para2
53
54       
55        self.model1= model1
56        self.model2= model2
57       
58       
59        ## dispersion
60        self._set_dispersion()
61        ## Define parameters
62        self._set_params()
63        ## Parameter details [units, min, max]
64        self._set_details()
65        #list of parameter that can be fitted
66        self._set_fixed_params() 
67        ## parameters with orientation
68        for item in self.model1.orientation_params:
69            self.orientation_params.append(item)
70           
71        for item in self.model2.orientation_params:
72            if not item in self.orientation_params:
73                self.orientation_params.append(item)
74               
75       
76    def _clone(self, obj):
77        """
78            Internal utility function to copy the internal
79            data members to a fresh copy.
80        """
81        obj.params     = copy.deepcopy(self.params)
82        obj.description     = copy.deepcopy(self.description)
83        obj.details    = copy.deepcopy(self.details)
84        obj.dispersion = copy.deepcopy(self.dispersion)
85        obj.model1  = self.model1.clone()
86        obj.model2  = self.model2.clone()
87       
88        return obj
89   
90   
91    def _set_dispersion(self):
92        """
93           combined the two models dispersions
94        """
95        for name , value in self.model1.dispersion.iteritems():
96            self.dispersion[name]= value
97           
98        for name , value in self.model2.dispersion.iteritems():
99            # S(Q) has only 'radius' for dispersion.
100            if not name in self.dispersion.keys()and name !='radius': 
101                self.dispersion[name]= value
102
103                   
104               
105               
106    def _set_params(self):
107        """
108            Concatenate the parameters of the two models to create
109            this model parameters
110        """
111       
112        for name , value in self.model1.params.iteritems():
113            self.params[name]= value
114           
115            if self.modelD !=None:
116                if name == self.para1 or name == self.para2:
117                    self.modelD.params[name]= value
118                elif name in self.model2.getParamList() and name !='radius':
119                    self.model2.setParam( name, value)
120
121            elif name in self.model2.getParamList():
122                self.model2.setParam(name, value)
123        if self.modelD !=None:
124            self.model2.setParam('radius', self.modelD.run())
125           
126        for name , value in self.model2.params.iteritems():
127            if not name in self.params.keys()and name != 'radius':
128                self.params[name]= value
129           
130    def _set_details(self):
131        """
132            Concatenate details of the two models to create
133            this model details
134        """
135        for name ,detail in self.model1.details.iteritems():
136            self.details[name]= detail
137           
138        for name , detail in self.model2.details.iteritems():
139            if not name in self.details.keys()and name != 'radius':
140                self.details[name]= detail
141               
142    def setParam(self, name, value):
143        """
144            Set the value of a model parameter
145       
146            @param name: name of the parameter
147            @param value: value of the parameter
148        """
149
150        self._setParamHelper( name, value)
151
152        if name in self.model1.getParamList():
153            self.model1.setParam( name, value)
154        if self.modelD !=None:
155            if name==self.para1 or name == self.para2:
156                    self.modelD.params[name]= value
157                    self.model2.setParam('radius', self.modelD.run())
158            elif name in self.model2.getParamList():
159                        self.model2.setParam( name, value)       
160        else:
161            if name in self.model2.getParamList():
162                self.model2.setParam( name, value)
163           
164       
165           
166        self._setParamHelper( name, value)
167       
168    def _setParamHelper(self, name, value):
169        """
170            Helper function to setparam
171        """
172        # Look for dispersion parameters
173        toks = name.split('.')
174        if len(toks)==2:
175            for item in self.dispersion.keys():
176                if item.lower()==toks[0].lower():
177                    for par in self.dispersion[item]:
178                        if par.lower() == toks[1].lower():
179                            self.dispersion[item][par] = value
180                            return
181        else:
182            # Look for standard parameter
183            for item in self.params.keys():
184                if item.lower()==name.lower():
185                    self.params[item] = value
186                    return
187           
188        raise ValueError, "Model does not contain parameter %s" % name
189   
190       
191   
192             
193   
194    def _set_fixed_params(self):
195        """
196             fill the self.fixed list with the two models fixed list
197        """
198        for item in self.model1.fixed:
199            self.fixed.append(item)
200           
201        for item in self.model2.fixed:
202            if not item in self.fixed:
203                self.fixed.append(item)
204        self.fixed.sort()
205               
206               
207    def run(self, x = 0.0):
208        """ Evaluate the model
209            @param x: input q-value (float or [float, float] as [r, theta])
210            @return: (DAB value)
211        """
212        return self.model1.run(x)*self.model2.run(x)
213   
214    def runXY(self, x = 0.0):
215        """ Evaluate the model
216            @param x: input q-value (float or [float, float] as [qx, qy])
217            @return: DAB value
218        """
219        return self.model1.runXY(x)* self.model2.runXY(x)
220   
221    def set_dispersion(self, parameter, dispersion):
222        """
223            Set the dispersion object for a model parameter
224            @param parameter: name of the parameter [string]
225            @dispersion: dispersion object of type DispersionModel
226        """
227        value= None
228        try:
229            if parameter in self.model1.dispersion.keys():
230                value= self.model1.set_dispersion(parameter, dispersion)
231            #There is no dispersion for the structure factors(S(Q)).
232            #ToDo: need to decide whether or not the dispersion for S(Q) has to be considered for P*S. 
233            elif parameter in self.model2.dispersion.keys()and name !='radius':
234                value= self.model2.set_dispersion(parameter, dispersion)
235            self._set_dispersion()
236            return value
237        except:
238            raise 
239
240
241   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.