source: sasview/sansmodels/src/sans/models/MultiplicationModel.py @ c16557c

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since c16557c was 3740b11, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 16 years ago

Plug-In Cylinder (Ellips)Model times StructureModels?, yet needs to be checked very soon.

  • Property mode set to 100644
File size: 8.4 KB
Line 
1
2from sans.models.BaseComponent import BaseComponent
3import numpy, math
4import copy
5from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
6from sans.models.DiamCylFunc import  DiamCylFunc
7from sans.models.DiamEllipFunc import  DiamEllipFunc
8class MultiplicationModel(BaseComponent):
9    """
10        Use for S(Q)*P(Q).
11        Perform multplication of two models.
12        Contains the models parameters combined.
13    """
14    def __init__(self, model1, model2 ):
15        BaseComponent.__init__(self)
16
17       
18        ## Setting  model name model description
19        self.description=""
20        if  model1.name != "NoStructure"and  model2.name != "NoStructure":
21             self.name = model1.name +" * "+ model2.name
22             self.description= self.name+"\n"
23             self.description +="see %s description and %s description"%( model1.name,
24                                                                         model2.name )
25        elif  model2.name != "NoStructure":
26            self.name = model2.name
27            self.description= model2.description
28        else :
29            self.name = model1.name
30            self.description= model1.description
31                       
32        #For virial coefficients for only two P(Q) models,"CylinderModel","EllipsoidModel". SphereModel works w/o it.
33        modelDiam = None
34        if model1.__class__.__name__ == "CylinderModel":
35            Model1DPlugin("DiamCylFunc")
36            modelDiam = DiamCylFunc()
37            para1 = 'radius'
38            para2 = 'length'
39           
40        elif model1.__class__.__name__  == "EllipsoidModel":
41            Model1DPlugin("DiamEllipFunc")
42            modelDiam = DiamEllipFunc()
43            para1 = 'radius_a'
44            para2 = 'radius_b'
45           
46        self.modelD = modelDiam
47       
48        if model1.__class__.__name__ == "CylinderModel" \
49            or model1.__class__.__name__  == "EllipsoidModel":
50         
51            self.para1 = para1
52            self.para2 = para2
53
54       
55        self.model1= model1
56        self.model2= model2
57       
58        #if modelDiam != None:
59           #self.model2.params["radius"]= DiamEllipFunc()
60       
61           #print "self.modelD",self.modelD.params,self.model1.params,self.model2.params   
62
63        ## dispersion
64        self._set_dispersion()
65        ## Define parameters
66        self._set_params()
67        ## Parameter details [units, min, max]
68        self._set_details()
69        #list of parameter that can be fitted
70        self._set_fixed_params() 
71       
72    def _clone(self, obj):
73        """
74            Internal utility function to copy the internal
75            data members to a fresh copy.
76        """
77        obj.params     = copy.deepcopy(self.params)
78        obj.description     = copy.deepcopy(self.description)
79        obj.details    = copy.deepcopy(self.details)
80        obj.dispersion = copy.deepcopy(self.dispersion)
81        obj.model1  = self.model1.clone()
82        obj.model2  = self.model2.clone()
83       
84        return obj
85   
86   
87    def _set_dispersion(self):
88        """
89           combined the two models dispersions
90        """
91        for name , value in self.model1.dispersion.iteritems():
92            self.dispersion[name]= value
93           
94        for name , value in self.model2.dispersion.iteritems():
95            if not name in self.dispersion.keys()and name !='radius':
96                self.dispersion[name]= value
97
98                   
99               
100               
101    def _set_params(self):
102        """
103            Concatenate the parameters of the two models to create
104            this model parameters
105        """
106       
107        for name , value in self.model1.params.iteritems():
108            self.params[name]= value
109           
110            if self.modelD !=None:
111                if name == self.para1 or name == self.para2:
112                    self.modelD.params[name]= value
113                elif name in self.model2.getParamList() and name !='radius':
114                    self.model2.setParam( name, value)
115
116            elif name in self.model2.getParamList():
117                self.model2.setParam(name, value)
118        if self.modelD !=None:
119            self.model2.setParam('radius', self.modelD.run())
120           
121        for name , value in self.model2.params.iteritems():
122            if not name in self.params.keys()and name != 'radius':
123                self.params[name]= value
124           
125    def _set_details(self):
126        """
127            Concatenate details of the two models to create
128            this model details
129        """
130        for name ,detail in self.model1.details.iteritems():
131            self.details[name]= detail
132           
133        for name , detail in self.model2.details.iteritems():
134            if not name in self.details.keys()and name != 'radius':
135                self.details[name]= detail
136               
137    def setParam(self, name, value):
138        """
139            Set the value of a model parameter
140       
141            @param name: name of the parameter
142            @param value: value of the parameter
143        """
144
145        self._setParamHelper( name, value)
146
147        if name in self.model1.getParamList():
148            self.model1.setParam( name, value)
149
150       
151        if self.modelD !=None:
152            if name == self.para1 or name == self.para2:
153                self.modelD.params[name]= value
154            elif name in self.model2.getParamList() and name != 'radius':
155                self.model2.setParam( name, value)
156        elif name in self.model2.getParamList()and name != 'radius':
157            self.model2.setParam( name, value) 
158           
159       
160        self._setParamHelper( name, value)
161       
162    def _setParamHelper(self, name, value):
163        """
164            Helper function to setparam
165        """
166        # Look for dispersion parameters
167        toks = name.split('.')
168        if len(toks)==2:
169            for item in self.dispersion.keys():
170                if item.lower()==toks[0].lower():
171                    for par in self.dispersion[item]:
172                        if par.lower() == toks[1].lower():
173                            self.dispersion[item][par] = value
174                            return
175        else:
176            # Look for standard parameter
177            for item in self.params.keys():
178                if item.lower()==name.lower():
179                    self.params[item] = value
180                    return
181           
182        raise ValueError, "Model does not contain parameter %s" % name
183   
184       
185   
186             
187   
188    def _set_fixed_params(self):
189        """
190             fill the self.fixed list with the two models fixed list
191        """
192        for item in self.model1.fixed:
193            self.fixed.append(item)
194           
195        for item in self.model2.fixed:
196            if not item in self.fixed:
197                self.fixed.append(item)
198        self.fixed.sort()
199               
200               
201    def run(self, x = 0.0):
202        """ Evaluate the model
203            @param x: input q-value (float or [float, float] as [r, theta])
204            @return: (DAB value)
205        """
206        #MultiplicationModel(self.model1, self.model2 )     
207           
208        if self.modelD!=None:
209            value = self.modelD.run(x)
210            self.model2.setParam( "radius", value)       
211                       
212            print "self.model2.setParam( radius, value)",value
213        return self.model1.run(x)*self.model2.run(x)
214   
215    def runXY(self, x = 0.0):
216        """ Evaluate the model
217            @param x: input q-value (float or [float, float] as [qx, qy])
218            @return: DAB value
219        """
220        return self.model1.runXY(x)* self.model2.runXY(x)
221   
222    def set_dispersion(self, parameter, dispersion):
223        """
224            Set the dispersion object for a model parameter
225            @param parameter: name of the parameter [string]
226            @dispersion: dispersion object of type DispersionModel
227        """
228        value= None
229        try:
230            if parameter in self.model1.getParamList():
231                value= self.model1.set_dispersion(parameter, dispersion)
232            elif parameter in self.model2.ParamList():
233                value= self.model2.set_dispersion(parameter, dispersion)
234            return value
235        except:
236            raise 
237
238
239   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.