source: sasview/sansmodels/src/python_wrapper/CBCCrystalModel.cpp @ 6e10cff

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 6e10cff was 67424cd, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 13 years ago

Reorganizing models in preparation of cpp cleanup
  • Property mode set to 100644
File size: 24.3 KB
RevLine 
[d5b6a9d]1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CBCCrystalModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY bcc.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "bcc.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CBCCrystalModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    BCCrystalModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CBCCrystalModel;
57
58
59static void
60CBCCrystalModel_dealloc(CBCCrystalModel* self)
61{
62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
[b1c3295]67   
[d5b6a9d]68
69}
70
71static PyObject *
72CBCCrystalModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CBCCrystalModel *self;
75   
76    self = (CBCCrystalModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CBCCrystalModel_init(CBCCrystalModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new BCCrystalModel();
90       
[b1c3295]91        // Initialize parameter dictionary
92        PyDict_SetItemString(self->params,"phi",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"dnn",Py_BuildValue("d",220.000000000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"sldSph",Py_BuildValue("d",0.000003000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"d_factor",Py_BuildValue("d",0.060000000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"psi",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",40.000000000000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"theta",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
101        PyDict_SetItemString(self->params,"sldSolv",Py_BuildValue("d",0.000006300000));
102        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
103        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
104        PyObject * disp_dict;
105        disp_dict = PyDict_New();
106        self->model->radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
107        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "radius", disp_dict);
108        disp_dict = PyDict_New();
109        self->model->phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
110        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "phi", disp_dict);
111        disp_dict = PyDict_New();
112        self->model->psi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
113        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "psi", disp_dict);
114        disp_dict = PyDict_New();
115        self->model->theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
116        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "theta", disp_dict);
117
[d5b6a9d]118
119         
120        // Create empty log
121        self->log = PyDict_New();
122       
[b1c3295]123       
[d5b6a9d]124
125    }
126    return 0;
127}
128
[b1c3295]129static char name_params[] = "params";
130static char def_params[] = "Parameters";
131static char name_dispersion[] = "dispersion";
132static char def_dispersion[] = "Dispersion parameters";
133static char name_log[] = "log";
134static char def_log[] = "Log";
135
[d5b6a9d]136static PyMemberDef CBCCrystalModel_members[] = {
[b1c3295]137    {name_params, T_OBJECT, offsetof(CBCCrystalModel, params), 0, def_params},
138        {name_dispersion, T_OBJECT, offsetof(CBCCrystalModel, dispersion), 0, def_dispersion},     
139    {name_log, T_OBJECT, offsetof(CBCCrystalModel, log), 0, def_log},
[d5b6a9d]140    {NULL}  /* Sentinel */
141};
142
143/** Read double from PyObject
144    @param p PyObject
145    @return double
146*/
147double CBCCrystalModel_readDouble(PyObject *p) {
148    if (PyFloat_Check(p)==1) {
149        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
150    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
151        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
152    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
153        return (double)PyLong_AsLong(p);
154    } else {
155        return 0.0;
156    }
157}
158/**
159 * Function to call to evaluate model
160 * @param args: input numpy array q[]
161 * @return: numpy array object
162 */
163 
164static PyObject *evaluateOneDim(BCCrystalModel* model, PyArrayObject *q){
165    PyArrayObject *result;
166   
167    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
168    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
169    {
170        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
171        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
172        return NULL;
173    }
[8f5b34a]174    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), PyArray_DOUBLE);
[d5b6a9d]175        if (result == NULL) {
176        const char * message= "Could not create result ";
177        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
178                return NULL;
179        }
[0b082f3]180#pragma omp parallel for
[d5b6a9d]181         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
182      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
183      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
184      *result_value =(*model)(q_value);
185        }
186    return PyArray_Return(result); 
187 }
188
189 /**
190 * Function to call to evaluate model
191 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
192 * @return: numpy array object
193 */
194 static PyObject * evaluateTwoDimXY( BCCrystalModel* model, 
195                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
196 {
197    PyArrayObject *result;
[0b082f3]198    int x_len, y_len, dims[1];
[d5b6a9d]199    //check validity of input vectors
200    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
201        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
202        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
203        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
204        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
205        return NULL;
206    }
207   
208        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
209               
210            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
211        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
212           
213            // Make a new double matrix of same dims
[8f5b34a]214        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
[d5b6a9d]215        if (result == NULL){
216            const char * message= "Could not create result ";
217        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
218            return NULL;
219            }
220       
221        /* Do the calculation. */
[0b082f3]222#pragma omp parallel for
223        for (int i=0; i< x_len; i++) {
[d5b6a9d]224            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
225                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
226                        double *result_value = (double *)(result->data +
227                              i*result->strides[0]);
228                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
229        }           
230        return PyArray_Return(result); 
231       
232        }else{
233                    PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
234                   "CBCCrystalModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
235                return NULL;
236                }       
237}
238/**
239 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
240 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
241 *
242 */ 
243static PyObject * evalDistribution(CBCCrystalModel *self, PyObject *args){
244        PyObject *qx, *qy;
245        PyArrayObject * pars;
246        int npars ,mpars;
247       
248        // Get parameters
249       
[b1c3295]250            // Reader parameter dictionary
251    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
252    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
253    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
254    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
255    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
256    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
257    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
258    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
259    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
260    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
261    // Read in dispersion parameters
262    PyObject* disp_dict;
263    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
264    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
265    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
266    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
267    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
268    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
269    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
270    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
271    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
[d5b6a9d]272
273       
274        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
275        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
276            PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
277                "CBCCrystalModel.evalDistribution expects a q value.");
278                return NULL;
279        }
280    // Check params
281       
282    if(PyArray_Check(pars)==1) {
283               
284            // Length of list should 1 or 2
285            npars = pars->nd; 
286            if(npars==1) {
287                // input is a numpy array
288                if (PyArray_Check(pars)) {
289                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
290                    }
291                }else{
292                    PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
293                   "CBCCrystalModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
294                return NULL;
295                }
296    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
297        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
298            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
299            if(mpars!=2) {
300                PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
301                        "CBCCrystalModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
302                return NULL;
303            }
304             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
305             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
306             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
307                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
308                           (PyArrayObject*)qy);
309                 }else{
310                    PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
311                   "CBCCrystalModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
312                return NULL;
313             }
314        }
315        PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
316                   "CBCCrystalModel.evalDistribution couln't be run.");
317        return NULL;
318       
319}
320
321/**
322 * Function to call to evaluate model
323 * @param args: input q or [q,phi]
324 * @return: function value
325 */
326static PyObject * run(CBCCrystalModel *self, PyObject *args) {
327        double q_value, phi_value;
328        PyObject* pars;
329        int npars;
330       
331        // Get parameters
332       
[b1c3295]333            // Reader parameter dictionary
334    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
335    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
336    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
337    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
338    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
339    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
340    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
341    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
342    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
343    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
344    // Read in dispersion parameters
345    PyObject* disp_dict;
346    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
347    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
348    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
349    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
350    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
351    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
352    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
353    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
354    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
[d5b6a9d]355
356       
357        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
358        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
359            PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
360                "CBCCrystalModel.run expects a q value.");
361                return NULL;
362        }
363         
364        // Check params
365        if( PyList_Check(pars)==1) {
366               
367                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
368            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
369            if(npars!=2) {
370                PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
371                        "CBCCrystalModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
372                return NULL;
373            }
374            // We have a vector q, get the q and phi values at which
375            // to evaluate I(q,phi)
376            q_value = CBCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
377            phi_value = CBCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
378            // Skip zero
379            if (q_value==0) {
380                return Py_BuildValue("d",0.0);
381            }
382                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
383
384        } else {
385
386                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
387                q_value = CBCCrystalModel_readDouble(pars);             
388               
389                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
390        }       
391}
392/**
393 * Function to call to calculate_ER
394 * @return: effective radius value
395 */
396static PyObject * calculate_ER(CBCCrystalModel *self) {
397
398        // Get parameters
399       
[b1c3295]400            // Reader parameter dictionary
401    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
402    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
403    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
404    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
405    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
406    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
407    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
408    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
409    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
410    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
411    // Read in dispersion parameters
412    PyObject* disp_dict;
413    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
414    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
415    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
416    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
417    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
418    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
419    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
420    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
421    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
[d5b6a9d]422
423               
424        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
425
426}
427/**
428 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
429 * @param args: input q or [qx, qy]]
430 * @return: function value
431 */
432static PyObject * runXY(CBCCrystalModel *self, PyObject *args) {
433        double qx_value, qy_value;
434        PyObject* pars;
435        int npars;
436       
437        // Get parameters
438       
[b1c3295]439            // Reader parameter dictionary
440    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
441    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
442    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
443    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
444    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
445    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
446    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
447    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
448    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
449    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
450    // Read in dispersion parameters
451    PyObject* disp_dict;
452    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
453    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
454    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
455    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
456    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
457    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
458    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
459    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
460    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
[d5b6a9d]461
462       
463        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
464        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
465            PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
466                "CBCCrystalModel.run expects a q value.");
467                return NULL;
468        }
469         
470        // Check params
471        if( PyList_Check(pars)==1) {
472               
473                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
474            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
475            if(npars!=2) {
476                PyErr_SetString(CBCCrystalModelError, 
477                        "CBCCrystalModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
478                return NULL;
479            }
480            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
481            // to evaluate I(qx,qy)
482            qx_value = CBCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
483            qy_value = CBCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
484            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
485
486        } else {
487
488                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
489                qx_value = CBCCrystalModel_readDouble(pars);           
490               
491                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
492        }       
493}
494
495static PyObject * reset(CBCCrystalModel *self, PyObject *args) {
[b1c3295]496   
[d5b6a9d]497
498    return Py_BuildValue("d",0.0);
499}
500
501static PyObject * set_dispersion(CBCCrystalModel *self, PyObject *args) {
502        PyObject * disp;
503        const char * par_name;
504
505        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
506            PyErr_SetString(CBCCrystalModelError,
507                "CBCCrystalModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
508                return NULL;
509        }
510        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
511        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
512
513
514        // Ugliness necessary to go from python to C
[b1c3295]515            // TODO: refactor this
516    if (!strcmp(par_name, "radius")) {
517        self->model->radius.dispersion = dispersion;
518    } else    if (!strcmp(par_name, "phi")) {
519        self->model->phi.dispersion = dispersion;
520    } else    if (!strcmp(par_name, "psi")) {
521        self->model->psi.dispersion = dispersion;
522    } else    if (!strcmp(par_name, "theta")) {
523        self->model->theta.dispersion = dispersion;
[d5b6a9d]524    } else {
525            PyErr_SetString(CBCCrystalModelError,
526                "CBCCrystalModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
527                return NULL;
528        }
529
530        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
531        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
532        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
533        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
534    return Py_BuildValue("i",1);
535}
536
537
538static PyMethodDef CBCCrystalModel_methods[] = {
539    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
540      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
541    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
542      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
543    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
544      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
545     
546    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
547      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
548    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
549      "Reset pair correlation"},
550    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
551      "Set the dispersion model for a given parameter"},
552   {NULL}
553};
554
555static PyTypeObject CBCCrystalModelType = {
556    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
557    0,                         /*ob_size*/
558    "CBCCrystalModel",             /*tp_name*/
559    sizeof(CBCCrystalModel),             /*tp_basicsize*/
560    0,                         /*tp_itemsize*/
561    (destructor)CBCCrystalModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
562    0,                         /*tp_print*/
563    0,                         /*tp_getattr*/
564    0,                         /*tp_setattr*/
565    0,                         /*tp_compare*/
566    0,                         /*tp_repr*/
567    0,                         /*tp_as_number*/
568    0,                         /*tp_as_sequence*/
569    0,                         /*tp_as_mapping*/
570    0,                         /*tp_hash */
571    0,                         /*tp_call*/
572    0,                         /*tp_str*/
573    0,                         /*tp_getattro*/
574    0,                         /*tp_setattro*/
575    0,                         /*tp_as_buffer*/
576    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
577    "CBCCrystalModel objects",           /* tp_doc */
578    0,                         /* tp_traverse */
579    0,                         /* tp_clear */
580    0,                         /* tp_richcompare */
581    0,                         /* tp_weaklistoffset */
582    0,                         /* tp_iter */
583    0,                         /* tp_iternext */
584    CBCCrystalModel_methods,             /* tp_methods */
585    CBCCrystalModel_members,             /* tp_members */
586    0,                         /* tp_getset */
587    0,                         /* tp_base */
588    0,                         /* tp_dict */
589    0,                         /* tp_descr_get */
590    0,                         /* tp_descr_set */
591    0,                         /* tp_dictoffset */
592    (initproc)CBCCrystalModel_init,      /* tp_init */
593    0,                         /* tp_alloc */
594    CBCCrystalModel_new,                 /* tp_new */
595};
596
597
598//static PyMethodDef module_methods[] = {
599//    {NULL}
600//};
601
602/**
603 * Function used to add the model class to a module
604 * @param module: module to add the class to
605 */ 
606void addCBCCrystalModel(PyObject *module) {
607        PyObject *d;
608       
609    if (PyType_Ready(&CBCCrystalModelType) < 0)
610        return;
611
612    Py_INCREF(&CBCCrystalModelType);
613    PyModule_AddObject(module, "CBCCrystalModel", (PyObject *)&CBCCrystalModelType);
614   
615    d = PyModule_GetDict(module);
[2605da22]616    static char error_name[] = "CBCCrystalModel.error";
617    CBCCrystalModelError = PyErr_NewException(error_name, NULL, NULL);
[d5b6a9d]618    PyDict_SetItemString(d, "CBCCrystalModelError", CBCCrystalModelError);
619}
[b1c3295]620
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.