1 | /** |
---|
2 | This software was developed by the University of Tennessee as part of the |
---|
3 | Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE) |
---|
4 | project funded by the US National Science Foundation. |
---|
5 | |
---|
6 | If you use DANSE applications to do scientific research that leads to |
---|
7 | publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the |
---|
8 | following sentence: |
---|
9 | |
---|
10 | "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547." |
---|
11 | |
---|
12 | copyright 2008, University of Tennessee |
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13 | */ |
---|
14 | #ifndef MODEL_CLASS_H |
---|
15 | #define MODEL_CLASS_H |
---|
16 | |
---|
17 | #include <vector> |
---|
18 | #include "parameters.hh" |
---|
19 | extern "C" { |
---|
20 | #include "cylinder.h" |
---|
21 | #include "parallelepiped.h" |
---|
22 | #include "lamellarPS.h" |
---|
23 | #include "lamellar.h" |
---|
24 | #include "fuzzysphere.h" |
---|
25 | } |
---|
26 | |
---|
27 | using namespace std; |
---|
28 | |
---|
29 | class EllipticalCylinderModel{ |
---|
30 | public: |
---|
31 | // Model parameters |
---|
32 | Parameter r_minor; |
---|
33 | Parameter scale; |
---|
34 | Parameter r_ratio; |
---|
35 | Parameter length; |
---|
36 | Parameter sldCyl; |
---|
37 | Parameter sldSolv; |
---|
38 | Parameter background; |
---|
39 | Parameter cyl_theta; |
---|
40 | Parameter cyl_phi; |
---|
41 | Parameter cyl_psi; |
---|
42 | |
---|
43 | // Constructor |
---|
44 | EllipticalCylinderModel(); |
---|
45 | |
---|
46 | // Operators to get I(Q) |
---|
47 | double operator()(double q); |
---|
48 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
49 | double calculate_ER(); |
---|
50 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
51 | }; |
---|
52 | class TriaxialEllipsoidModel{ |
---|
53 | public: |
---|
54 | // Model parameters |
---|
55 | Parameter scale; |
---|
56 | Parameter semi_axisA; |
---|
57 | Parameter semi_axisB; |
---|
58 | Parameter semi_axisC; |
---|
59 | Parameter sldEll; |
---|
60 | Parameter sldSolv; |
---|
61 | Parameter background; |
---|
62 | Parameter axis_theta; |
---|
63 | Parameter axis_phi; |
---|
64 | Parameter axis_psi; |
---|
65 | |
---|
66 | // Constructor |
---|
67 | TriaxialEllipsoidModel(); |
---|
68 | |
---|
69 | // Operators to get I(Q) |
---|
70 | double operator()(double q); |
---|
71 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
72 | double calculate_ER(); |
---|
73 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
74 | }; |
---|
75 | |
---|
76 | class FlexibleCylinderModel{ |
---|
77 | public: |
---|
78 | // Model parameters |
---|
79 | Parameter scale; |
---|
80 | Parameter length; |
---|
81 | Parameter kuhn_length; |
---|
82 | Parameter radius; |
---|
83 | Parameter sldCyl; |
---|
84 | Parameter sldSolv; |
---|
85 | Parameter background; |
---|
86 | |
---|
87 | // Constructor |
---|
88 | FlexibleCylinderModel(); |
---|
89 | |
---|
90 | // Operators to get I(Q) |
---|
91 | double operator()(double q); |
---|
92 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
93 | double calculate_ER(); |
---|
94 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
95 | }; |
---|
96 | |
---|
97 | class FlexCylEllipXModel{ |
---|
98 | public: |
---|
99 | // Model parameters |
---|
100 | Parameter scale; |
---|
101 | Parameter length; |
---|
102 | Parameter kuhn_length; |
---|
103 | Parameter radius; |
---|
104 | Parameter axis_ratio; |
---|
105 | Parameter sldCyl; |
---|
106 | Parameter sldSolv; |
---|
107 | Parameter background; |
---|
108 | |
---|
109 | // Constructor |
---|
110 | FlexCylEllipXModel(); |
---|
111 | |
---|
112 | // Operators to get I(Q) |
---|
113 | double operator()(double q); |
---|
114 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
115 | double calculate_ER(); |
---|
116 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
117 | }; |
---|
118 | |
---|
119 | class StackedDisksModel{ |
---|
120 | public: |
---|
121 | // Model parameters |
---|
122 | Parameter scale; |
---|
123 | Parameter core_thick; |
---|
124 | Parameter radius; |
---|
125 | Parameter layer_thick; |
---|
126 | Parameter core_sld; |
---|
127 | Parameter layer_sld; |
---|
128 | Parameter solvent_sld; |
---|
129 | Parameter n_stacking; |
---|
130 | Parameter sigma_d; |
---|
131 | Parameter background; |
---|
132 | Parameter axis_theta; |
---|
133 | Parameter axis_phi; |
---|
134 | |
---|
135 | // Constructor |
---|
136 | StackedDisksModel(); |
---|
137 | |
---|
138 | // Operators to get I(Q) |
---|
139 | double operator()(double q); |
---|
140 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
141 | double calculate_ER(); |
---|
142 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
143 | }; |
---|
144 | |
---|
145 | class LamellarModel{ |
---|
146 | public: |
---|
147 | // Model parameters |
---|
148 | Parameter scale; |
---|
149 | Parameter bi_thick; |
---|
150 | Parameter sld_bi; |
---|
151 | Parameter sld_sol; |
---|
152 | Parameter background; |
---|
153 | |
---|
154 | // Constructor |
---|
155 | LamellarModel(); |
---|
156 | |
---|
157 | // Operators to get I(Q) |
---|
158 | double operator()(double q); |
---|
159 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
160 | double calculate_ER(); |
---|
161 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
162 | |
---|
163 | }; |
---|
164 | |
---|
165 | class LamellarFFHGModel{ |
---|
166 | public: |
---|
167 | // Model parameters |
---|
168 | Parameter scale; |
---|
169 | Parameter t_length; |
---|
170 | Parameter h_thickness; |
---|
171 | Parameter sld_tail; |
---|
172 | Parameter sld_head; |
---|
173 | Parameter sld_solvent; |
---|
174 | Parameter background; |
---|
175 | |
---|
176 | // Constructor |
---|
177 | LamellarFFHGModel(); |
---|
178 | |
---|
179 | // Operators to get I(Q) |
---|
180 | double operator()(double q); |
---|
181 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
182 | double calculate_ER(); |
---|
183 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
184 | |
---|
185 | }; |
---|
186 | |
---|
187 | |
---|
188 | |
---|
189 | class LamellarPSModel{ |
---|
190 | public: |
---|
191 | // Model parameters |
---|
192 | Parameter scale; |
---|
193 | Parameter spacing; |
---|
194 | Parameter delta; |
---|
195 | Parameter sld_bi; |
---|
196 | Parameter sld_sol; |
---|
197 | Parameter n_plates; |
---|
198 | Parameter caille; |
---|
199 | Parameter background; |
---|
200 | |
---|
201 | // Constructor |
---|
202 | LamellarPSModel(); |
---|
203 | |
---|
204 | // Operators to get I(Q) |
---|
205 | double operator()(double q); |
---|
206 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
207 | double calculate_ER(); |
---|
208 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
209 | }; |
---|
210 | |
---|
211 | class LamellarPSHGModel{ |
---|
212 | public: |
---|
213 | // Model parameters |
---|
214 | Parameter scale; |
---|
215 | Parameter spacing; |
---|
216 | Parameter deltaT; |
---|
217 | Parameter deltaH; |
---|
218 | Parameter sld_tail; |
---|
219 | Parameter sld_head; |
---|
220 | Parameter sld_solvent; |
---|
221 | Parameter n_plates; |
---|
222 | Parameter caille; |
---|
223 | Parameter background; |
---|
224 | |
---|
225 | // Constructor |
---|
226 | LamellarPSHGModel(); |
---|
227 | |
---|
228 | // Operators to get I(Q) |
---|
229 | double operator()(double q); |
---|
230 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
231 | double calculate_ER(); |
---|
232 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
233 | }; |
---|
234 | |
---|
235 | |
---|
236 | class LamellarPCrystalModel{ |
---|
237 | public: |
---|
238 | // Model parameters |
---|
239 | Parameter scale; |
---|
240 | Parameter thickness; |
---|
241 | Parameter Nlayers; |
---|
242 | Parameter spacing; |
---|
243 | Parameter pd_spacing; |
---|
244 | Parameter sld_layer; |
---|
245 | Parameter sld_solvent; |
---|
246 | Parameter background; |
---|
247 | |
---|
248 | // Constructor |
---|
249 | LamellarPCrystalModel(); |
---|
250 | |
---|
251 | // Operators to get I(Q) |
---|
252 | double operator()(double q); |
---|
253 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
254 | double calculate_ER(); |
---|
255 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
256 | }; |
---|
257 | |
---|
258 | class CoreShellEllipsoidModel{ |
---|
259 | public: |
---|
260 | // Model parameters |
---|
261 | Parameter scale; |
---|
262 | Parameter equat_core; |
---|
263 | Parameter polar_core; |
---|
264 | Parameter equat_shell; |
---|
265 | Parameter polar_shell; |
---|
266 | Parameter sld_core; |
---|
267 | Parameter sld_shell; |
---|
268 | Parameter sld_solvent; |
---|
269 | Parameter background; |
---|
270 | Parameter axis_theta; |
---|
271 | Parameter axis_phi; |
---|
272 | |
---|
273 | // Constructor |
---|
274 | CoreShellEllipsoidModel(); |
---|
275 | |
---|
276 | // Operators to get I(Q) |
---|
277 | double operator()(double q); |
---|
278 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
279 | double calculate_ER(); |
---|
280 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
281 | }; |
---|
282 | |
---|
283 | class HollowCylinderModel{ |
---|
284 | public: |
---|
285 | // Model parameters |
---|
286 | Parameter scale; |
---|
287 | Parameter core_radius; |
---|
288 | Parameter radius; |
---|
289 | Parameter length; |
---|
290 | Parameter sldCyl; |
---|
291 | Parameter sldSolv; |
---|
292 | Parameter background; |
---|
293 | Parameter axis_theta; |
---|
294 | Parameter axis_phi; |
---|
295 | |
---|
296 | //Constructor |
---|
297 | HollowCylinderModel(); |
---|
298 | |
---|
299 | //Operators to get I(Q) |
---|
300 | double operator()(double q); |
---|
301 | double operator()(double qx , double qy); |
---|
302 | double calculate_ER(); |
---|
303 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
304 | }; |
---|
305 | |
---|
306 | class MultiShellModel{ |
---|
307 | public: |
---|
308 | // Model parameters |
---|
309 | Parameter scale; |
---|
310 | Parameter core_radius; |
---|
311 | Parameter s_thickness; |
---|
312 | Parameter w_thickness; |
---|
313 | Parameter core_sld; |
---|
314 | Parameter shell_sld; |
---|
315 | Parameter n_pairs; |
---|
316 | Parameter background; |
---|
317 | |
---|
318 | //Constructor |
---|
319 | MultiShellModel(); |
---|
320 | |
---|
321 | //Operators to get I(Q) |
---|
322 | double operator()(double q); |
---|
323 | double operator()(double qx , double qy); |
---|
324 | double calculate_ER(); |
---|
325 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
326 | }; |
---|
327 | |
---|
328 | class VesicleModel{ |
---|
329 | public: |
---|
330 | // Model parameters |
---|
331 | Parameter scale; |
---|
332 | Parameter radius; |
---|
333 | Parameter thickness; |
---|
334 | Parameter core_sld; |
---|
335 | Parameter shell_sld; |
---|
336 | Parameter background; |
---|
337 | |
---|
338 | //Constructor |
---|
339 | VesicleModel(); |
---|
340 | |
---|
341 | //Operators to get I(Q) |
---|
342 | double operator()(double q); |
---|
343 | double operator()(double qx , double qy); |
---|
344 | double calculate_ER(); |
---|
345 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
346 | }; |
---|
347 | |
---|
348 | class BinaryHSModel{ |
---|
349 | public: |
---|
350 | // Model parameters |
---|
351 | Parameter l_radius; |
---|
352 | Parameter s_radius; |
---|
353 | Parameter vol_frac_ls; |
---|
354 | Parameter vol_frac_ss; |
---|
355 | Parameter ls_sld; |
---|
356 | Parameter ss_sld; |
---|
357 | Parameter solvent_sld; |
---|
358 | Parameter background; |
---|
359 | |
---|
360 | //Constructor |
---|
361 | BinaryHSModel(); |
---|
362 | |
---|
363 | //Operators to get I(Q) |
---|
364 | double operator()(double q); |
---|
365 | double operator()(double qx , double qy); |
---|
366 | double calculate_ER(); |
---|
367 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
368 | }; |
---|
369 | |
---|
370 | class BinaryHSPSF11Model{ |
---|
371 | public: |
---|
372 | // Model parameters |
---|
373 | Parameter l_radius; |
---|
374 | Parameter s_radius; |
---|
375 | Parameter vol_frac_ls; |
---|
376 | Parameter vol_frac_ss; |
---|
377 | Parameter ls_sld; |
---|
378 | Parameter ss_sld; |
---|
379 | Parameter solvent_sld; |
---|
380 | Parameter background; |
---|
381 | |
---|
382 | //Constructor |
---|
383 | BinaryHSPSF11Model(); |
---|
384 | |
---|
385 | //Operators to get I(Q) |
---|
386 | double operator()(double q); |
---|
387 | double operator()(double qx , double qy); |
---|
388 | double calculate_ER(); |
---|
389 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
390 | }; |
---|
391 | |
---|
392 | class Poly_GaussCoil{ |
---|
393 | public: |
---|
394 | // Model parameters |
---|
395 | Parameter rg; |
---|
396 | Parameter scale; |
---|
397 | Parameter poly_m; |
---|
398 | Parameter background; |
---|
399 | |
---|
400 | // Constructor |
---|
401 | Poly_GaussCoil(); |
---|
402 | |
---|
403 | // Operators to get I(Q) |
---|
404 | double operator()(double q); |
---|
405 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
406 | double calculate_ER(); |
---|
407 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
408 | }; |
---|
409 | |
---|
410 | class FractalModel{ |
---|
411 | public: |
---|
412 | // Model parameters |
---|
413 | Parameter radius; |
---|
414 | Parameter scale; |
---|
415 | Parameter fractal_dim; |
---|
416 | Parameter cor_length; |
---|
417 | Parameter sldBlock; |
---|
418 | Parameter sldSolv; |
---|
419 | Parameter background; |
---|
420 | |
---|
421 | // Constructor |
---|
422 | FractalModel(); |
---|
423 | |
---|
424 | // Operators to get I(Q) |
---|
425 | double operator()(double q); |
---|
426 | double operator()(double qx, double qy); |
---|
427 | double calculate_ER(); |
---|
428 | double evaluate_rphi(double q, double phi); |
---|
429 | }; |
---|
430 | |
---|
431 | #endif |
---|