source: sasview/park_integration/test/test_fit_cylinder.py @ cfbe9b5

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since cfbe9b5 was 8bbab51, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 16 years ago

modified tests
  • Property mode set to 100644
File size: 5.5 KB
Line 
1"""
2    Unit tests for fitting module
3"""
4import unittest
5from sans.guitools.plottables import Theory1D
6from sans.guitools.plottables import Data1D
7from sans.fit.AbstractFitEngine import Data, Model
8import math
9from sans.fit.Fitting import Fit
10from DataLoader.loader import Loader
11
12class testFitModule(unittest.TestCase):
13    """ test fitting """
14   
15    def test_scipy(self):
16        """ Simple cylinder model fit (scipy)  """
17       
18        out=Loader().load("cyl_400_20.txt")
19        data1 = Data1D(x=out.x, y=out.y, dx=out.dx, dy=out.y)
20       
21        fitter = Fit('scipy')
22        # Receives the type of model for the fitting
23        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
24        model1  = CylinderModel()
25        model1.setParam('contrast', 1)
26        data = Data(sans_data=data1)
27        model = Model(model1)
28       
29        pars1 =['length','radius','scale']
30        fitter.set_data(data,1)
31        model.set(scale=1e-10)
32        fitter.set_model(model,1,pars1)
33        fitter.select_problem_for_fit(Uid=1,value=1)
34        result1 = fitter.fit()
35       
36        self.assert_(result1)
37        self.assertTrue(len(result1.pvec)>0 or len(result1.pvec)==0 )
38        self.assertTrue(len(result1.stderr)> 0 or len(result1.stderr)==0)
39       
40        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[0]-400.0)/3.0 < result1.stderr[0] )
41        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[1]-20.0)/3.0  < result1.stderr[1] )
42        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[2]-9.0e-12)/3.0   < result1.stderr[2] )
43        self.assertTrue( result1.fitness < 1.0 )
44       
45    def test_park(self):
46        """ Simple cylinder model fit (park)  """
47       
48        out=Loader().load("cyl_400_20.txt")
49        data1 = Data1D(x=out.x, y=out.y, dx=out.dx, dy=out.y)
50       
51        fitter = Fit('park')
52        # Receives the type of model for the fitting
53        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
54        model1  = CylinderModel()
55       
56        data = Data(sans_data=data1)
57        model = Model(model1)
58       
59        pars1 =['length','radius','scale']
60        fitter.set_data(data,1)
61        model.set(contrast= 1)
62        model.set(scale=1e-10)
63        fitter.set_model(model,1,pars1)
64        fitter.select_problem_for_fit(Uid=1,value=1)
65        result1 = fitter.fit()
66       
67        self.assert_(result1)
68        self.assertTrue(len(result1.pvec)>0 or len(result1.pvec)==0 )
69        self.assertTrue(len(result1.stderr)> 0 or len(result1.stderr)==0)
70       
71        print result1.pvec[0]-400.0, result1.pvec[0]
72        print math.fabs(result1.pvec[0]-400.0)/3.0
73        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[0]-400.0)/3.0 < result1.stderr[0] )
74        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[1]-20.0)/3.0  < result1.stderr[1] )
75        self.assertTrue( math.fabs(result1.pvec[2]-9.0e-12)/3.0   < result1.stderr[2] )
76        self.assertTrue( result1.fitness < 1.0 )
77       
78    def test_park2(self):
79        """ Simultaneous cylinder model fit (park)  """
80       
81        out=Loader().load("cyl_400_20.txt")
82        data1 = Data1D(x=out.x, y=out.y, dx=out.dx, dy=out.y)
83       
84        out2=Loader().load("cyl_400_40.txt")
85        data2 = Data1D(x=out2.x, y=out2.y, dx=out2.dx, dy=out2.y)
86       
87        fitter = Fit('park')
88        # Receives the type of model for the fitting
89        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
90        cyl1  = CylinderModel()
91        cyl1.name = "C1"
92       
93        data1 = Data(sans_data=data1)
94        model1 = Model(cyl1)
95        model1.set(contrast=1)
96        model1.set(scale= 1e-10)
97        fitter.set_data(data1,1)
98        fitter.set_model(model1, 1, ['length','radius','scale'])
99       
100        cyl2  = CylinderModel()
101        cyl2.name = "C2"
102       
103        data2 = Data(sans_data=data2)
104        # This is wrong. We should not store string as
105        # parameter values
106        # Why not inherit our AbstracFitEngine.Model from Park.Model?
107       
108        #cyl2.setParam('length', 'C1.length')
109        #print "read back:", cyl2.getParam('length')
110       
111        model2 = Model(cyl2)
112        model2.set(length='C1.length')
113        model2.set(contrast=1)
114        model2.set(scale= 1e-10)
115        fitter.set_data(data2,2)
116        fitter.set_model(model2, 2, ['radius','scale'])
117        fitter.select_problem_for_fit(Uid=1,value=1)
118        fitter.select_problem_for_fit(Uid=2,value=1)
119        result1 = fitter.fit()
120       
121        self.assert_(result1)
122        self.assertTrue(len(result1.pvec)>0 or len(result1.pvec)==0 )
123        self.assertTrue(len(result1.stderr)> 0 or len(result1.stderr)==0)
124       
125        for par in result1.parameters:
126            if par.name=='C1.length':
127                print par.name, par.value
128                self.assertTrue( math.fabs(par.value-400.0)/3.0 < par.stderr )
129            elif par.name=='C1.radius':
130                print par.name, par.value
131                self.assertTrue( math.fabs(par.value-20.0)/3.0 < par.stderr )
132            elif par.name=='C2.radius':
133                print par.name, par.value
134                self.assertTrue( math.fabs(par.value-40.0)/3.0 < par.stderr )
135            elif par.name=='C1.scale':
136                print par.name, par.value
137                self.assertTrue( math.fabs(par.value-9.0e-12)/3.0 < par.stderr )
138            elif par.name=='C2.scale':
139                print par.name, par.value
140                self.assertTrue( math.fabs(par.value-9.0e-12)/3.0 < par.stderr )
141           
142       
143       
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.