source: sasview/guiframe/data_loader.py @ ff54ce7

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since ff54ce7 was ff54ce7, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

Working on tiff reader
  • Property mode set to 100644
File size: 7.3 KB
Line 
1import os, sys,numpy
2import wx
3from dataFitting import Data1D, Theory1D
4from danse.common.plottools.plottables import Data2D
5from DataLoader.loader import Loader
6
7def choose_data_file(parent, location=None):
8    path = None
9    if location==None:
10        location = os.getcwd()
11   
12    l = Loader()
13    cards = l.get_wildcards()
14    wlist = '|'.join(cards)
15   
16    dlg = wx.FileDialog(parent, "Choose a file", location, "", wlist, wx.OPEN)
17    if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
18        path = dlg.GetPath()
19        mypath = os.path.basename(path)
20    dlg.Destroy()
21   
22    return path
23
24
25def load_ascii_1D(path):
26    """
27        Load a 1D ascii file, with errors
28    """
29    if path and os.path.isfile(path):
30   
31        file_x = numpy.zeros(0)
32        file_y = numpy.zeros(0)
33        file_dy = numpy.zeros(0)
34        file_dx = numpy.zeros(0)
35       
36        input_f = open(path,'r')
37        buff = input_f.read()
38        lines = buff.split('\n')
39       
40        has_dy = False
41        has_dx = False
42       
43        for line in lines:
44            try:
45                toks = line.split()
46                x = float(toks[0])
47                y = float(toks[1])
48                if len(toks)==3:
49                    has_dy = True
50                    errdy = float(toks[2])
51                else:
52                    errdy = 0.0
53                if len(toks)==4:
54                    has_dx = True
55                    errdx = float(toks[3])
56                else:
57                    errdx = 0.0
58                file_x  = numpy.append(file_x, x)
59                file_y  = numpy.append(file_y, y)
60                file_dy = numpy.append(file_dy, dyerr)
61                file_dx = numpy.append(file_dx, dxerr)
62            except:
63                print "READ ERROR", line
64   
65        if has_dy==False:
66            file_dy = None
67        if has_dx==False:
68            file_dx = None
69           
70        return file_x, file_y, file_dy, file_dx
71    return None, None, None
72
73def plot_data(parent, path):
74    """
75        Use the DataLoader loader to created data to plot.
76        @param path: the path of the data to load
77    """
78    from sans.guicomm.events import NewPlotEvent, StatusEvent
79    from DataLoader.loader import  Loader
80   
81    #Instantiate a loader
82    L = Loader()
83   
84    #Recieves data
85    try:
86        output=L.load(path)
87       
88    except:
89        wx.PostEvent(parent, StatusEvent(status="Problem loading file: %s" % sys.exc_value))
90        return
91    filename = os.path.basename(path)
92   
93    if not  output.__class__.__name__=="list":
94        ## smearing info
95        try:
96            dxl = output.dxl
97            dxw = output.dxw
98        except:
99            dxl = None
100            dxw = None
101        ## data 's name
102        if output.filename==None:
103            output.filename=str(filename)
104           
105        ## Creating a Data2D with output
106        if hasattr(output,'data'):
107            temp = output.err_data
108            temp[temp==0]=1
109            msg= "Loading 2D error bars of value 1 were added to"
110            wx.PostEvent(parent, StatusEvent(status=" %s %s"% (msg,output.filename)))
111            new_plot = Data2D(image=output.data,err_image=temp,
112                              xmin=output.xmin,xmax=output.xmax,
113                              ymin=output.ymin,ymax=output.ymax)
114            new_plot.x_bins=output.x_bins
115            new_plot.y_bins=output.y_bins
116           
117        ## Creating a pic image2D with output   
118        elif hasattr(output,'image'):
119            msg= "Note that RGB was modified to fit the SansView plot platform..."
120            wx.PostEvent(parent, StatusEvent(status=" %s %s"% (msg,output.filename)))
121            new_plot = Data2D(image=output.image,
122                              xmin=output.xmin,xmax=output.xmax,
123                              ymin=output.ymin,ymax=output.ymax, pictype = 'image')
124            new_plot.x_bins=output.x_bins
125            new_plot.y_bins=output.y_bins
126            #new_plot.scale = 'linear'
127        ##Creating Data1D with output
128        else:
129            ##dy values checked
130            if output.dy ==None :
131                new_plot = Theory1D(output.x,output.y, dxl, dxw)
132               
133            elif len(output.dy[output.dy==0])==len(output.dy):
134                output.dy[output.dy==0]=1 
135                msg="Loading 1D error bars of value 1 were added to "
136                wx.PostEvent(parent, StatusEvent(status= "%s %s"%(msg, output.filename)))
137                new_plot = Theory1D(output.x,output.y,output.dy, dxl, dxw)
138            else:
139                msg="Loading 1D data: "
140                wx.PostEvent(parent, StatusEvent(status= "%s %s"%(msg, output.filename)))
141                new_plot = Data1D(x=output.x, y=output.y, dx=output.dx,
142                                  dy=output.dy, dxl=dxl, dxw=dxw)
143               
144        ## source will request in dataLoader .manipulation module
145        new_plot.source=output.source
146        ## name of the data allow to differentiate data when plotted
147        name= output.filename
148       
149           
150        #print "data_name_list",data_name_list
151        new_plot.name = name
152        ## allow to highlight data when plotted
153        new_plot.interactive = True
154        ## when 2 data have the same id override the 1 st plotted
155        new_plot.id = name
156        ## info is a reference to output of dataloader that can be used
157        ## to save  data 1D as cansas xml file
158        new_plot.info= output
159        ## detector used by dataLoader.manipulation module
160        new_plot.detector =output.detector
161        ## If the data file does not tell us what the axes are, just assume...
162        new_plot.xaxis(output._xaxis,output._xunit)
163        new_plot.yaxis(output._yaxis,output._yunit)
164        ##group_id specify on which panel to plot this data
165        new_plot.group_id = name
166        ##post data to plot
167        wx.PostEvent(parent, NewPlotEvent(plot=new_plot, title=str(name)))
168       
169    ## the output of the loader is a list , some xml files contain more than one data
170    else:
171        i=1
172        for item in output:
173            try:
174                dx=item.dx
175                dxl=item.dxl
176                dxw=item.dxw
177            except:
178                dx=None
179                dxl=None
180                dxw=None
181               
182            if item.dy ==None:
183                new_plot = Theory1D(item.x,item.y,dxl,dxw)
184            else:
185                new_plot = Data1D(x=item.x,y=item.y,dx=dx,dy=item.dy,dxl=dxl,dxw=dxw)
186           
187            new_plot.source=item.source
188           
189            name= str(item.run[0])
190           
191            new_plot.name = name
192            new_plot.interactive = True
193            new_plot.detector =item.detector
194            # If the data file does not tell us what the axes are, just assume...
195            new_plot.xaxis(item._xaxis,item._xunit)
196            new_plot.yaxis(item._yaxis,item._yunit)
197            new_plot.group_id = name
198            new_plot.id = name
199            new_plot.info= item
200           
201            if hasattr(item,"title"):
202                title= item.title
203            else:
204                title= name
205            wx.PostEvent(parent, NewPlotEvent(plot=new_plot, title=str(title)))
206            i+=1
207           
208           
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.