source: sasview/DataLoader/readers/tiff_reader.py @ e390933

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since e390933 was 8bd8ea4, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 16 years ago

Added IGOR 1D reader and unified ascii readers

  • Property mode set to 100644
File size: 3.8 KB
Line 
1
2import math,logging
3
4   
5class Reader:
6    """
7        Example data manipulation
8    """
9    ## File type
10    type = []
11    ## Extension
12    ext  = ['tif', 'jpg', '.png', 'jpeg', '.tiff', 'gif', 'bmp']   
13       
14    def read(self, filename=None):
15        import Image
16        print "in tiff"
17        """
18            Open and read the data in a file
19            @param file: path of the file
20        """
21       
22        read_it = False
23        for item in self.ext:
24            if filename.lower().find(item)>=0:
25                read_it = True
26               
27        if read_it:
28            import Image
29            import pylab
30            import copy
31            import numpy
32           
33            wavelength, distance, center_x, center_y, pixel = 10.0, 11.0, 65, 65, 1.0
34           
35           
36           
37            # Initialize
38            x_vals = []
39            y_vals = [] 
40            ymin = None
41            ymax = None
42            xmin = None
43            xmax = None
44            Z = None
45       
46            try:
47                im = Image.open(filename)
48            except :
49                raise  RuntimeError,"cannot open %s"%(filename)
50            # Detector size should be 128x128, the file is 190x190
51            print "-> Image size:", im.size, im.format, im.mode
52            data = im.getdata()
53            x = numpy.zeros(im.size[0])
54            y = numpy.zeros(im.size[1])
55            X, Y = pylab.meshgrid(x, y)
56            Z = copy.deepcopy(X)
57            itot = 0
58            i_x = 0
59            i_y = 0
60           
61            # Qx and Qy vectors
62            for i_x in range(im.size[0]):
63                theta = (i_x-center_x+1)*pixel / distance / 100.0
64                qx = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
65                x_vals.append(qx)
66                if xmin==None or qx<xmin:
67                    xmin = qx
68                if xmax==None or qx>xmax:
69                    xmax = qx
70           
71            ymin = None
72            ymax = None
73            for i_y in range(im.size[1]):
74                theta = (i_y-center_y+1)*pixel / distance / 100.0
75                qy = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
76                y_vals.append(qy)
77                if ymin==None or qy<ymin:
78                    ymin = qy
79                if ymax==None or qy>ymax:
80                    ymax = qy
81           
82            for val in data:
83               
84                try:
85                    value = float(val)
86                except:
87                    continue
88               
89                # Get bin number
90                if math.fmod(itot, im.size[0])==0:
91                    i_x = 0
92                    i_y += 1
93                else:
94                    i_x += 1
95                   
96                Z[im.size[1]-1-i_y][i_x] = value
97               
98                itot += 1
99            from readInfo import ReaderInfo     
100            output = ReaderInfo()
101            output.wavelength = wavelength
102            output.xbins      = im.size[0]
103            output.ybins      = im.size[1]
104            output.center_x   = center_x
105            output.center_y   = center_y
106            output.distance   = distance
107            output.x_vals     = x_vals
108            output.y_vals     = y_vals
109            output.xmin       = xmin
110            output.xmax       = xmax
111            output.ymin       = ymin
112            output.ymax       = ymax
113            output.image      = Z
114            output.pixel_size = pixel
115            output.x          = x_vals
116            output.y          = y_vals
117            output.type       ="2D"
118            logging.info("tiff_reader reading %s"%(filename))
119           
120            return output
121       
122        return None
123
124
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.