source: sasview/DataLoader/readers/hfir1d_reader.py @ c52f66f

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since c52f66f was fe78c7b, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 15 years ago

DataLoader?: exception no longer raised when units are wrong for an entry; the entry is not loaded and an error is logged instead. Loader info is now stored.

  • Property mode set to 100644
File size: 5.0 KB
RevLine 
[bee885e]1"""
2This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4project funded by the US National Science Foundation.
5
6See the license text in license.txt
7
8copyright 2008, University of Tennessee
9"""
10
11import numpy
12import os
13from DataLoader.data_info import Data1D
14
15# Check whether we have a converter available
16has_converter = True
17try:
18    from data_util.nxsunit import Converter
19except:
20    has_converter = False
21
22class Reader(object):
23    """
24        Class to load HFIR 1D 4-column files
25    """
26    ## File type
[28caa03]27    type_name = "HFIR 1D"   
28    ## Wildcards
[bee885e]29    type = ["HFIR 1D files (*.d1d)|*.d1d"]
30    ## List of allowed extensions
31    ext=['.d1d'] 
32   
33    def read(self, path):
34        """
35            Load data file
36           
37            @param path: file path
38            @return: Data1D object, or None
39            @raise RuntimeError: when the file can't be opened
40            @raise ValueError: when the length of the data vectors are inconsistent
41        """
42        if os.path.isfile(path):
43            basename  = os.path.basename(path)
44            root, extension = os.path.splitext(basename)
45            if extension.lower() in self.ext:
46                try:
47                    input_f =  open(path,'r')
48                except :
49                    raise  RuntimeError, "hfir1d_reader: cannot open %s" % path
50                buff = input_f.read()
51                lines = buff.split('\n')
52                x  = numpy.zeros(0)
53                y  = numpy.zeros(0)
54                dx = numpy.zeros(0)
55                dy = numpy.zeros(0)
56                output = Data1D(x, y, dx=dx, dy=dy)
57                self.filename = output.filename = basename
58           
59                data_conv_q = None
60                data_conv_i = None
61               
[ca10d8e]62                if has_converter == True and output.x_unit != '1/A':
63                    data_conv_q = Converter('1/A')
[bee885e]64                    # Test it
65                    data_conv_q(1.0, output.x_unit)
66                   
[ca10d8e]67                if has_converter == True and output.y_unit != '1/cm':
68                    data_conv_i = Converter('1/cm')
[bee885e]69                    # Test it
70                    data_conv_i(1.0, output.y_unit)
71                           
72                for line in lines:
73                    toks = line.split()
74                    try:
75                        _x = float(toks[0])
76                        _y = float(toks[1])
77                        _dx = float(toks[3])
78                        _dy = float(toks[2])
79                       
80                        if data_conv_q is not None:
81                            _x = data_conv_q(_x, units=output.x_unit)
82                            _dx = data_conv_q(_dx, units=output.x_unit)
83                           
84                        if data_conv_i is not None:
85                            _y = data_conv_i(_y, units=output.y_unit)                       
86                            _dy = data_conv_i(_dy, units=output.y_unit)                       
87                                                   
88
89                        x   = numpy.append(x, _x) 
90                        y   = numpy.append(y, _y)
91                        dx  = numpy.append(dx, _dx)
92                        dy  = numpy.append(dy, _dy)                       
93                    except:
94                        # Couldn't parse this line, skip it
95                        pass
96                         
97                     
98                # Sanity check
99                if not len(y) == len(dy):
100                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: y and dy have different length"
101                if not len(x) == len(dx):
102                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: x and dx have different length"
103
104                # If the data length is zero, consider this as
105                # though we were not able to read the file.
106                if len(x)==0:
107                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: could not load file"
108               
109                output.x = x
110                output.y = y
111                output.dy = dy
112                output.dx = dx
113                if data_conv_q is not None:
114                    output.xaxis("\\rm{Q}", output.x_unit)
115                else:
116                    output.xaxis("\\rm{Q}", 'A^{-1}')
117                if data_conv_i is not None:
[0e2aa40]118                    output.yaxis("\\rm{Intensity}", output.y_unit)
[bee885e]119                else:
[0e2aa40]120                    output.yaxis("\\rm{Intensity}","cm^{-1}")
[bee885e]121               
[fe78c7b]122                # Store loading process information
123                output.meta_data['loader'] = self.type_name   
[bee885e]124                return output
125        else:
126            raise RuntimeError, "%s is not a file" % path
127        return None
128   
129if __name__ == "__main__": 
130    reader = Reader()
131    print reader.read("../test/S2-30dq.d1d")
132   
133   
134                       
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.