source: sasview/DataLoader/readers/IgorReader.py @ d22da51

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since d22da51 was c125e0c, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 16 years ago

unit test added
  • Property mode set to 100644
File size: 5.2 KB
Line 
1import os, sys
2import pylab
3from copy import deepcopy
4import math
5class Reader:
6    """ Simple data reader for Igor data files """
7   
8    def __init__(self, filename=None):
9        """ Init
10            @param filename: Name of Igor data file to read
11        """
12        self.file = filename
13        self.x = []
14        self.y = []
15        self.image = []
16       
17        # Detector info
18        self.wavelength = 0.0
19        self.distance   = 0.0
20        self.center_x   = 63.5
21        self.center_y   = 63.5
22       
23    def read(self,filename=None):
24        """ Read file """
25        # Check if the file is there
26        self.file=filename
27        if not os.path.isfile(self.file):
28            raise ValueError, \
29            "Specified file %s is not a regular file" % self.file
30       
31        # Read file
32        f = open(self.file,'r')
33        buf = f.read()
34       
35        # Get content
36        dataStarted = False
37       
38       
39        lines = buf.split('\n')
40        itot = 0
41        self.x = []
42        self.y = []
43        self.image = []
44       
45        ncounts = 0
46       
47        #x = pylab.arange(0, 128, 1)
48        #y = pylab.arange(0, 128, 1)
49        x = pylab.arange(-.5, .5, 1.0/128)
50        y = pylab.arange(-.5, .5, 1.0/128)
51        X, Y = pylab.meshgrid(x, y)
52        Z = deepcopy(X)
53       
54        xmin = None
55        xmax = None
56        ymin = None
57        ymax = None
58       
59        i_x = 0
60        i_y = -1
61       
62        isInfo = False
63        isCenter = False
64        for line in lines:
65           
66            # Find setup info line
67            if isInfo:
68                isInfo = False
69                line_toks = line.split()
70                # Wavelength in Angstrom
71                try:
72                    wavelength = float(line_toks[1])
73                except:
74                    raise ValueError,"IgorReader: can't read this file, missing wavelength"
75                # Distance in meters
76                try:
77                    distance = float(line_toks[3])
78                except:
79                    raise ValueError,"IgorReader: can't read this file, missing distance"
80               
81            if line.count("LAMBDA")>0:
82                isInfo = True
83               
84            # Find center info line
85            if isCenter:
86                isCenter = False               
87                line_toks = line.split()
88                # Center in bin number
89                center_x = float(line_toks[0])
90                center_y = float(line_toks[1])
91
92            if line.count("BCENT")>0:
93                isCenter = True
94               
95       
96            # Find data start
97            if line.count("***")>0:
98                dataStarted = True
99               
100                # Check that we have all the info
101                if wavelength == None \
102                    or distance == None \
103                    or center_x == None \
104                    or center_y == None:
105                    raise ValueError, "IgorReader:Missing information in data file"
106               
107            if dataStarted == True:
108                try:
109                    value = float(line)
110                except:
111                    continue
112               
113                # Get bin number
114                if math.fmod(itot, 128)==0:
115                    i_x = 0
116                    i_y += 1
117                else:
118                    i_x += 1
119                   
120                Z[i_y][i_x] = value
121                ncounts += 1 
122               
123                # Det 640 x 640 mm
124                # Q = 4pi/lambda sin(theta/2)
125                # Bin size is 0.5 cm
126                theta = (i_x-center_x+1)*0.5 / distance / 100.0
127                qx = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
128                if xmin==None or qx<xmin:
129                    xmin = qx
130                if xmax==None or qx>xmax:
131                    xmax = qx
132               
133                theta = (i_y-center_y+1)*0.5 / distance / 100.0
134                qy = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
135                if ymin==None or qy<ymin:
136                    ymin = qy
137                if ymax==None or qy>ymax:
138                    ymax = qy
139               
140               
141                if not qx in self.x:
142                    self.x.append(qx)
143                if not qy in self.y:
144                    self.y.append(qy)
145               
146                itot += 1
147                 
148                 
149        theta = 0.25 / distance / 100.0
150        xstep = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
151       
152        theta = 0.25 / distance / 100.0
153        ystep = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
154       
155        # Store q max
156        if xmax>ymax:
157            self.qmax = xmax
158        else:
159            self.qmax = ymax
160       
161        #config.printEVT("Read %g points from file %s" % (ncounts, self.file))
162 
163        self.wavelength = wavelength
164        self.distance   = distance*1000.0
165        self.center_x = center_x
166        self.center_y = center_y
167        print "IgorReader reading %s"%self.file
168        return Z, xmin-xstep/2.0, xmax+xstep/2.0, ymin-ystep/2.0, ymax+ystep/2.0
169     
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.