source: sasview/DataLoader/plugins/tiff_reader.py @ 9cd84ee

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 9cd84ee was 3dd7cce, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 16 years ago

passing error_conditions test
  • Property mode set to 100644
File size: 4.2 KB
RevLine 
[0fc05f9]1
2import Image
3import math
4class ReaderInfo:
5    """
6    """
7    ## Wavelength [A]
8    wavelength = 0.0
9    ## Number of x bins
10    xbins = 128
11    ## Number of y bins
12    ybins = 128
13    ## Beam center X [pixel number]
14    center_x = 65
15    ## Beam center Y [pixel number]
16    center_y = 65
17    ## Distance from sample to detector [m]
18    distance = 11.0
19    ## Qx values [A-1]
20    x_vals = []
21    ## Qy xalues [A-1]
22    y_vals = []
23    ## Qx min
24    xmin = 0.0
25    ## Qx max
26    xmax = 1.0
27    ## Qy min
28    ymin = 0.0
29    ## Qy max
30    ymax = 1.0
31    ## Image
32    image = None
33    ## Pixel size
34    pixel_size = 0.5
35    ## Error on each pixel
36    error = None
37   
38class Reader:
39    """
40        Example data manipulation
41    """
42    ## File type
43    type = []
44    ## Extension
45    ext  = ['tif', 'jpg', '.png', 'jpeg', '.tiff', 'gif', 'bmp']   
46       
47    def read(self, filename=None):
48        """
49            Open and read the data in a file
50            @param file: path of the file
51        """
52       
53        read_it = False
54        for item in self.ext:
55            if filename.lower().find(item)>=0:
56                read_it = True
57               
58        if read_it:
59            import Image
60            import pylab
61            import copy
62            import numpy
63           
64            wavelength, distance, center_x, center_y, pixel = 10.0, 11.0, 65, 65, 1.0
65           
66           
67           
68            # Initialize
69            x_vals = []
70            y_vals = [] 
71            ymin = None
72            ymax = None
73            xmin = None
74            xmax = None
75            Z = None
76       
[3dd7cce]77            try:
78                im = Image.open(filename)
79            except :
80                raise  RuntimeError,"cannot open %s"%(filename)
[0fc05f9]81            # Detector size should be 128x128, the file is 190x190
82            print "-> Image size:", im.size, im.format, im.mode
83            data = im.getdata()
84            x = numpy.zeros(im.size[0])
85            y = numpy.zeros(im.size[1])
86            X, Y = pylab.meshgrid(x, y)
87            Z = copy.deepcopy(X)
88            itot = 0
89            i_x = 0
90            i_y = 0
91           
92            # Qx and Qy vectors
93            for i_x in range(im.size[0]):
94                theta = (i_x-center_x+1)*pixel / distance / 100.0
95                qx = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
96                x_vals.append(qx)
97                if xmin==None or qx<xmin:
98                    xmin = qx
99                if xmax==None or qx>xmax:
100                    xmax = qx
101           
102            ymin = None
103            ymax = None
104            for i_y in range(im.size[1]):
105                theta = (i_y-center_y+1)*pixel / distance / 100.0
106                qy = 4.0*math.pi/wavelength * math.sin(theta/2.0)
107                y_vals.append(qy)
108                if ymin==None or qy<ymin:
109                    ymin = qy
110                if ymax==None or qy>ymax:
111                    ymax = qy
112           
113            for val in data:
114               
115                try:
116                    value = float(val)
117                except:
118                    continue
119               
120                # Get bin number
121                if math.fmod(itot, im.size[0])==0:
122                    i_x = 0
123                    i_y += 1
124                else:
125                    i_x += 1
126                   
127                Z[im.size[1]-1-i_y][i_x] = value
128               
129                itot += 1
130               
131            output = ReaderInfo()
132            output.wavelength = wavelength
133            output.xbins      = im.size[0]
134            output.ybins      = im.size[1]
135            output.center_x   = center_x
136            output.center_y   = center_y
137            output.distance   = distance
138            output.x_vals     = x_vals
139            output.y_vals     = y_vals
140            output.xmin       = xmin
141            output.xmax       = xmax
142            output.ymin       = ymin
143            output.ymax       = ymax
144            output.image      = Z
145            output.pixel_size = pixel
146               
147            return output
148       
149        return None
150
151
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.