Changeset 2a0b2b1 in sasmodels for sasmodels/models/core_shell_bicelle.c


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Apr 14, 2017 8:30:29 AM (7 years ago)
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Paul Kienzle <pkienzle@…>
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master, core_shell_microgels, magnetic_model, ticket-1257-vesicle-product, ticket_1156, ticket_1265_superball, ticket_822_more_unit_tests
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fdd56a1
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9901384
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restructure all 2D models to work with (qa,qb,qc) = rotate(qx,qy) rather than working with angles directly in preparation for revised jitter algorithm

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  • sasmodels/models/core_shell_bicelle.c

    rb260926 r2a0b2b1  
    1 double form_volume(double radius, double thick_rim, double thick_face, double length); 
    2 double Iq(double q, 
    3           double radius, 
    4           double thick_rim, 
    5           double thick_face, 
    6           double length, 
    7           double core_sld, 
    8           double face_sld, 
    9           double rim_sld, 
    10           double solvent_sld); 
    11  
    12  
    13 double Iqxy(double qx, double qy, 
    14           double radius, 
    15           double thick_rim, 
    16           double thick_face, 
    17           double length, 
    18           double core_sld, 
    19           double face_sld, 
    20           double rim_sld, 
    21           double solvent_sld, 
    22           double theta, 
    23           double phi); 
    24  
    25  
    26 double form_volume(double radius, double thick_rim, double thick_face, double length) 
     1static double 
     2form_volume(double radius, double thick_rim, double thick_face, double length) 
    273{ 
    28     return M_PI*(radius+thick_rim)*(radius+thick_rim)*(length+2.0*thick_face); 
     4    return M_PI*square(radius+thick_rim)*(length+2.0*thick_face); 
    295} 
    306 
    317static double 
    32 bicelle_kernel(double q, 
    33               double rad, 
    34               double radthick, 
    35               double facthick, 
    36               double halflength, 
    37               double rhoc, 
    38               double rhoh, 
    39               double rhor, 
    40               double rhosolv, 
    41               double sin_alpha, 
    42               double cos_alpha) 
     8bicelle_kernel(double qab, 
     9    double qc, 
     10    double radius, 
     11    double thick_radius, 
     12    double thick_face, 
     13    double halflength, 
     14    double sld_core, 
     15    double sld_face, 
     16    double sld_rim, 
     17    double sld_solvent) 
    4318{ 
    44     const double dr1 = rhoc-rhoh; 
    45     const double dr2 = rhor-rhosolv; 
    46     const double dr3 = rhoh-rhor; 
    47     const double vol1 = M_PI*square(rad)*2.0*(halflength); 
    48     const double vol2 = M_PI*square(rad+radthick)*2.0*(halflength+facthick); 
    49     const double vol3 = M_PI*square(rad)*2.0*(halflength+facthick); 
     19    const double dr1 = sld_core-sld_face; 
     20    const double dr2 = sld_rim-sld_solvent; 
     21    const double dr3 = sld_face-sld_rim; 
     22    const double vol1 = M_PI*square(radius)*2.0*(halflength); 
     23    const double vol2 = M_PI*square(radius+thick_radius)*2.0*(halflength+thick_face); 
     24    const double vol3 = M_PI*square(radius)*2.0*(halflength+thick_face); 
    5025 
    51     const double be1 = sas_2J1x_x(q*(rad)*sin_alpha); 
    52     const double be2 = sas_2J1x_x(q*(rad+radthick)*sin_alpha); 
    53     const double si1 = sas_sinx_x(q*(halflength)*cos_alpha); 
    54     const double si2 = sas_sinx_x(q*(halflength+facthick)*cos_alpha); 
     26    const double be1 = sas_2J1x_x((radius)*qab); 
     27    const double be2 = sas_2J1x_x((radius+thick_radius)*qab); 
     28    const double si1 = sas_sinx_x((halflength)*qc); 
     29    const double si2 = sas_sinx_x((halflength+thick_face)*qc); 
    5530 
    5631    const double t = vol1*dr1*si1*be1 + 
    … …  
    5833                     vol3*dr3*si2*be1; 
    5934 
    60     const double retval = t*t; 
    61  
    62     return retval; 
    63  
     35    return t; 
    6436} 
    6537 
    6638static double 
    67 bicelle_integration(double q, 
    68                    double rad, 
    69                    double radthick, 
    70                    double facthick, 
    71                    double length, 
    72                    double rhoc, 
    73                    double rhoh, 
    74                    double rhor, 
    75                    double rhosolv) 
     39Iq(double q, 
     40    double radius, 
     41    double thick_radius, 
     42    double thick_face, 
     43    double length, 
     44    double sld_core, 
     45    double sld_face, 
     46    double sld_rim, 
     47    double sld_solvent) 
    7648{ 
    7749    // set up the integration end points 
    … …  
    7951    const double halflength = 0.5*length; 
    8052 
    81     double summ = 0.0; 
     53    double total = 0.0; 
    8254    for(int i=0;i<N_POINTS_76;i++) { 
    83         double alpha = (Gauss76Z[i] + 1.0)*uplim; 
    84         double sin_alpha, cos_alpha; // slots to hold sincos function output 
    85         SINCOS(alpha, sin_alpha, cos_alpha); 
    86         double yyy = Gauss76Wt[i] * bicelle_kernel(q, rad, radthick, facthick, 
    87                              halflength, rhoc, rhoh, rhor, rhosolv, 
    88                              sin_alpha, cos_alpha); 
    89         summ += yyy*sin_alpha; 
     55        double theta = (Gauss76Z[i] + 1.0)*uplim; 
     56        double sin_theta, cos_theta; // slots to hold sincos function output 
     57        SINCOS(theta, sin_theta, cos_theta); 
     58        double fq = bicelle_kernel(q*sin_theta, q*cos_theta, radius, thick_radius, thick_face, 
     59                                   halflength, sld_core, sld_face, sld_rim, sld_solvent); 
     60        total += Gauss76Wt[i]*fq*fq*sin_theta; 
    9061    } 
    9162 
    9263    // calculate value of integral to return 
    93     double answer = uplim*summ; 
    94     return answer; 
     64    double answer = total*uplim; 
     65    return 1.0e-4*answer; 
    9566} 
    9667 
    9768static double 
    98 bicelle_kernel_2d(double qx, double qy, 
    99           double radius, 
    100           double thick_rim, 
    101           double thick_face, 
    102           double length, 
    103           double core_sld, 
    104           double face_sld, 
    105           double rim_sld, 
    106           double solvent_sld, 
    107           double theta, 
    108           double phi) 
     69Iqxy(double qx, double qy, 
     70    double radius, 
     71    double thick_rim, 
     72    double thick_face, 
     73    double length, 
     74    double core_sld, 
     75    double face_sld, 
     76    double rim_sld, 
     77    double solvent_sld, 
     78    double theta, 
     79    double phi) 
    10980{ 
    11081    double q, sin_alpha, cos_alpha; 
    11182    ORIENT_SYMMETRIC(qx, qy, theta, phi, q, sin_alpha, cos_alpha); 
     83    const double qab = q*sin_alpha; 
     84    const double qc = q*cos_alpha; 
    11285 
    113     double answer = bicelle_kernel(q, radius, thick_rim, thick_face, 
     86    double fq = bicelle_kernel(qab, qc, radius, thick_rim, thick_face, 
    11487                           0.5*length, core_sld, face_sld, rim_sld, 
    115                            solvent_sld, sin_alpha, cos_alpha); 
    116     return 1.0e-4*answer; 
     88                           solvent_sld); 
     89    return 1.0e-4*fq*fq; 
    11790} 
    118  
    119 double Iq(double q, 
    120           double radius, 
    121           double thick_rim, 
    122           double thick_face, 
    123           double length, 
    124           double core_sld, 
    125           double face_sld, 
    126           double rim_sld, 
    127           double solvent_sld) 
    128 { 
    129     double intensity = bicelle_integration(q, radius, thick_rim, thick_face, 
    130                        length, core_sld, face_sld, rim_sld, solvent_sld); 
    131     return intensity*1.0e-4; 
    132 } 
    133  
    134  
    135 double Iqxy(double qx, double qy, 
    136           double radius, 
    137           double thick_rim, 
    138           double thick_face, 
    139           double length, 
    140           double core_sld, 
    141           double face_sld, 
    142           double rim_sld, 
    143           double solvent_sld, 
    144           double theta, 
    145           double phi) 
    146 { 
    147     double intensity = bicelle_kernel_2d(qx, qy, 
    148                       radius, 
    149                       thick_rim, 
    150                       thick_face, 
    151                       length, 
    152                       core_sld, 
    153                       face_sld, 
    154                       rim_sld, 
    155                       solvent_sld, 
    156                       theta, 
    157                       phi); 
    158  
    159     return intensity; 
    160 } 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.