source: sasview/src/sas/sasgui/perspectives/corfunc/corfunc_panel.py @ ebfdf4b

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since ebfdf4b was ebfdf4b, checked in by lewis, 8 years ago

Add help button to corfunc perspective

  • Property mode set to 100644
File size: 24.9 KB
Line 
1import wx
2import sys
3import numpy as np
4from wx.lib.scrolledpanel import ScrolledPanel
5from sas.sasgui.guiframe.events import PlotQrangeEvent
6from sas.sasgui.guiframe.events import StatusEvent
7from sas.sasgui.guiframe.panel_base import PanelBase
8from sas.sasgui.guiframe.utils import check_float
9from sas.sasgui.guiframe.dataFitting import Data1D
10from sas.sasgui.perspectives.invariant.invariant_widgets import OutputTextCtrl
11from sas.sasgui.perspectives.invariant.invariant_widgets import InvTextCtrl
12from sas.sasgui.perspectives.fitting.basepage import ModelTextCtrl
13from sas.sasgui.perspectives.corfunc.corfunc_state import CorfuncState
14import sas.sasgui.perspectives.corfunc.corfunc
15from sas.sascalc.corfunc.corfunc_calculator import CorfuncCalculator
16from sas.sasgui.guiframe.documentation_window import DocumentationWindow
17from plot_labels import *
18
19OUTPUT_STRINGS = {
20    'max': "Long Period (A): ",
21    'Lc': "Average Hard Block Thickness (A): ",
22    'dtr': "Average Interface Thickness (A): ",
23    'd0': "Average Core Thickness: ",
24    'A': "Polydispersity: ",
25    'fill': "Local Crystallinity: "
26}
27
28if sys.platform.count("win32") > 0:
29    _STATICBOX_WIDTH = 350
30    PANEL_WIDTH = 400
31    PANEL_HEIGHT = 700
32    FONT_VARIANT = 0
33else:
34    _STATICBOX_WIDTH = 390
35    PANEL_WIDTH = 430
36    PANEL_HEIGHT = 700
37    FONT_VARIANT = 1
38
39class CorfuncPanel(ScrolledPanel,PanelBase):
40    window_name = "Correlation Function"
41    window_caption = "Correlation Function"
42    CENTER_PANE = True
43
44    def __init__(self, parent, data=None, manager=None, *args, **kwds):
45        kwds["size"] = (PANEL_WIDTH, PANEL_HEIGHT)
46        kwds["style"] = wx.FULL_REPAINT_ON_RESIZE
47        ScrolledPanel.__init__(self, parent=parent, *args, **kwds)
48        PanelBase.__init__(self, parent)
49        self.SetupScrolling()
50        self.SetWindowVariant(variant=FONT_VARIANT)
51        self._manager = manager
52        # The data with no correction for background values
53        self._data = data # The data to be analysed (corrected fr background)
54        self._extrapolated_data = None # The extrapolated data set
55        self._transformed_data = None # Fourier trans. of the extrapolated data
56        self._calculator = CorfuncCalculator()
57        self._data_name_box = None # Text box to show name of file
58        self._background_input = None
59        self._qmin_input = None
60        self._qmax1_input = None
61        self._qmax2_input = None
62        self._transform_btn = None
63        self._extract_btn = None
64        self.qmin = 0
65        self.qmax = (0, 0)
66        self.background = 0
67        self.extracted_params = None
68        self.transform_type = 'fourier'
69        # Dictionary for saving refs to text boxes used to display output data
70        self._output_boxes = None
71        self.state = None
72        self._do_layout()
73        self._disable_inputs()
74        self.set_state()
75        self._qmin_input.Bind(wx.EVT_TEXT, self._on_enter_input)
76        self._qmax1_input.Bind(wx.EVT_TEXT, self._on_enter_input)
77        self._qmax2_input.Bind(wx.EVT_TEXT, self._on_enter_input)
78        self._qmin_input.Bind(wx.EVT_MOUSE_EVENTS, self._on_click_qrange)
79        self._qmax1_input.Bind(wx.EVT_MOUSE_EVENTS, self._on_click_qrange)
80        self._qmax2_input.Bind(wx.EVT_MOUSE_EVENTS, self._on_click_qrange)
81        self._background_input.Bind(wx.EVT_TEXT, self._on_enter_input)
82
83    def set_state(self, state=None, data=None):
84        """
85        Set the state of the panel. If no state is provided, the panel will
86        be set to the default state.
87
88        :param state: A CorfuncState object
89        :param data: A Data1D object
90        """
91        if state is None:
92            self.state = CorfuncState()
93        else:
94            self.state = state
95        if data is not None:
96            self.state.data = data
97        self.set_data(data, set_qrange=False)
98        if self.state.qmin is not None:
99            self.set_qmin(self.state.qmin)
100        if self.state.qmax is not None and self.state.qmax != (None, None):
101            self.set_qmax(tuple(self.state.qmax))
102        if self.state.background is not None:
103            self.set_background(self.state.background)
104        if self.state.is_extrapolated:
105            self.compute_extrapolation()
106        else:
107            return
108        if self.state.is_transformed:
109            self.compute_transform()
110        else:
111            return
112        if self.state.outputs is not None and self.state.outputs != {}:
113            self.set_extracted_params(self.state.outputs, reset=True)
114
115    def get_state(self):
116        """
117        Return the state of the panel
118        """
119        state = CorfuncState()
120        state.set_saved_state('qmin_tcl', self.qmin)
121        state.set_saved_state('qmax1_tcl', self.qmax[0])
122        state.set_saved_state('qmax2_tcl', self.qmax[1])
123        state.set_saved_state('background_tcl', self.background)
124        state.outputs = self.extracted_params
125        if self._data is not None:
126            state.file = self._data.title
127            state.data = self._data
128        if self._extrapolated_data is not None:
129            state.is_extrapolated = True
130        if self._transformed_data is not None:
131            state.is_transformed = True
132        self.state = state
133
134        return self.state
135
136    def onSetFocus(self, evt):
137        if evt is not None:
138            evt.Skip()
139        self._validate_inputs()
140
141    def set_data(self, data=None, set_qrange=True):
142        """
143        Update the GUI to reflect new data that has been loaded in
144
145        :param data: The data that has been loaded
146        """
147        if data is None:
148            return
149        self._enable_inputs()
150        self._transform_btn.Disable()
151        self._extract_btn.Disable()
152        self._data_name_box.SetValue(str(data.title))
153        self._data = data
154        self._calculator.set_data(data)
155        # Reset the outputs
156        self.set_extracted_params(None, reset=True)
157        if self._manager is not None:
158            self._manager.clear_data()
159            self._manager.show_data(self._data, IQ_DATA_LABEL, reset=True)
160
161        if set_qrange:
162            lower = data.x[-1]*0.05
163            upper1 = data.x[-1] - lower*5
164            upper2 = data.x[-1]
165            self.set_qmin(lower)
166            self.set_qmax((upper1, upper2))
167            self.set_background(self._calculator.compute_background(self.qmax))
168
169    def get_data(self):
170        return self._data
171
172    def radio_changed(self, event=None):
173        if event is not None:
174            self.transform_type = event.GetEventObject().GetName()
175
176    def compute_extrapolation(self, event=None):
177        """
178        Compute and plot the extrapolated data.
179        Called when Extrapolate button is pressed.
180        """
181        if not self._validate_inputs:
182            msg = "Invalid Q range entered."
183            wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=msg))
184            return
185        self._calculator.set_data(self._data)
186        self._calculator.lowerq = self.qmin
187        self._calculator.upperq = self.qmax
188        self._calculator.background = self.background
189        try:
190            self._extrapolated_data = self._calculator.compute_extrapolation()
191        except:
192            msg = "Error extrapolating data."
193            wx.PostEvent(self._manager.parent,
194                StatusEvent(status=msg, info="Error"))
195            self._transform_btn.Disable()
196            return
197        # TODO: Find way to set xlim and ylim so full range of data can be
198        # plotted but zoomed in
199        maxq = self._data.x.max()
200        mask = self._extrapolated_data.x <= maxq
201        numpts = len(self._extrapolated_data.x[mask]) + 250
202        plot_x = self._extrapolated_data.x[0:numpts]
203        plot_y = self._extrapolated_data.y[0:numpts]
204        to_plot = Data1D(plot_x, plot_y)
205        self._manager.show_data(to_plot, IQ_EXTRAPOLATED_DATA_LABEL)
206        # Update state of the GUI
207        self._transform_btn.Enable()
208        self._extract_btn.Disable()
209        self.set_extracted_params(reset=True)
210
211    def compute_transform(self, event=None):
212        """
213        Compute and plot the transformed data.
214        Called when Transform button is pressed.
215        """
216        if not self._calculator.transform_isrunning():
217            self._calculator.compute_transform(self._extrapolated_data,
218                self.transform_type, background=self.background,
219                completefn=self.transform_complete,
220                updatefn=self.transform_update)
221
222            self._transform_btn.SetLabel("Stop Tansform")
223        else:
224            self._calculator.stop_transform()
225            self.transform_update("Transform cancelled.")
226            self._transform_btn.SetLabel("Tansform")
227
228    def transform_update(self, msg=""):
229        """
230        Called from FourierThread to update on status of calculation
231        """
232        wx.PostEvent(self._manager.parent,
233            StatusEvent(status=msg))
234
235    def transform_complete(self, transform=None):
236        """
237        Called from FourierThread when calculation has completed
238        """
239        self._transform_btn.SetLabel("Tansform")
240        if transform is None:
241            msg = "Error calculating Transform."
242            if self.transform_type == 'hilbert':
243                msg = "Not yet implemented"
244            wx.PostEvent(self._manager.parent,
245                StatusEvent(status=msg, info="Error"))
246            self._extract_btn.Disable()
247            return
248        self._transformed_data = transform
249        import numpy as np
250        plot_x = transform.x[np.where(transform.x <= 200)]
251        plot_y = transform.y[np.where(transform.x <= 200)]
252        self._manager.show_data(Data1D(plot_x, plot_y), TRANSFORM_LABEL)
253        # Only enable extract params button if a fourier trans. has been done
254        if self.transform_type == 'fourier':
255            self._extract_btn.Enable()
256        else:
257            self._extract_btn.Disable()
258
259    def extract_parameters(self, event=None):
260        try:
261            params = self._calculator.extract_parameters(self._transformed_data)
262        except:
263            params = None
264        if params is None:
265            msg = "Error extracting parameters."
266            wx.PostEvent(self._manager.parent,
267                StatusEvent(status=msg, info="Error"))
268            return
269        self.set_extracted_params(params)
270
271    def on_help(self, event=None):
272        """
273        Show the corfunc documentation
274        """
275        tree_location = "user/sasgui/perspectives/corfunc/corfunc_help.html"
276        doc_viewer = DocumentationWindow(self, -1, tree_location, "",
277                                          "Correlation Function Help")
278
279    def save_project(self, doc=None):
280        """
281        Return an XML node containing the state of the panel
282
283        :param doc: Am xml node to attach the project state to (optional)
284        """
285        data = self._data
286        state = self.get_state()
287        if data is not None:
288            new_doc, sasentry = self._manager.state_reader._to_xml_doc(data)
289            new_doc = state.toXML(doc=new_doc, entry_node=sasentry)
290            if new_doc is not None:
291                if doc is not None and hasattr(doc, "firstChild"):
292                    child = new_doc.getElementsByTagName("SASentry")
293                    for item in child:
294                        doc.firstChild.appendChild(item)
295                else:
296                    doc = new_doc
297        return doc
298
299    def set_qmin(self, qmin):
300        self.qmin = qmin
301        self._qmin_input.SetValue(str(qmin))
302
303    def set_qmax(self, qmax):
304        self.qmax = qmax
305        self._qmax1_input.SetValue(str(qmax[0]))
306        self._qmax2_input.SetValue(str(qmax[1]))
307
308    def set_background(self, bg):
309        self.background = bg
310        self._background_input.SetValue(str(bg))
311        self._calculator.background = bg
312
313    def set_extracted_params(self, params=None, reset=False):
314        self.extracted_params = params
315        error = False
316        if params is None:
317            if not reset: error = True
318            for key in OUTPUT_STRINGS.keys():
319                self._output_boxes[key].SetValue('-')
320        else:
321            if len(params) < len(OUTPUT_STRINGS):
322                # Not all parameters were calculated
323                error = True
324            for key, value in params.iteritems():
325                rounded = self._round_sig_figs(value, 6)
326                self._output_boxes[key].SetValue(rounded)
327        if error:
328            msg = 'Not all parameters were able to be calculated'
329            wx.PostEvent(self._manager.parent, StatusEvent(
330                status=msg, info='error'))
331
332
333    def plot_qrange(self, active=None, leftdown=False):
334        if active is None:
335            active = self._qmin_input
336        wx.PostEvent(self._manager.parent, PlotQrangeEvent(
337            ctrl=[self._qmin_input, self._qmax1_input, self._qmax2_input],
338            active=active, id=IQ_DATA_LABEL, is_corfunc=True,
339            group_id=GROUP_ID_IQ_DATA, leftdown=leftdown))
340
341
342    def _compute_background(self, event=None):
343        self.set_background(self._calculator.compute_background(self.qmax))
344
345    def _on_enter_input(self, event=None):
346        """
347        Read values from input boxes and save to memory.
348        """
349        if event is not None: event.Skip()
350        if not self._validate_inputs():
351            return
352        self.qmin = float(self._qmin_input.GetValue())
353        new_qmax1 = float(self._qmax1_input.GetValue())
354        new_qmax2 = float(self._qmax2_input.GetValue())
355        self.qmax = (new_qmax1, new_qmax2)
356        self.background = float(self._background_input.GetValue())
357        self._calculator.background = self.background
358        if event is not None:
359            active_ctrl = event.GetEventObject()
360            if active_ctrl == self._background_input:
361                self._manager.show_data(self._data, IQ_DATA_LABEL,
362                    reset=False, active_ctrl=active_ctrl)
363
364    def _on_click_qrange(self, event=None):
365        if event is None:
366            return
367        event.Skip()
368        if not self._validate_inputs(): return
369        self.plot_qrange(active=event.GetEventObject(),
370            leftdown=event.LeftDown())
371
372    def _validate_inputs(self):
373        """
374        Check that the values for qmin and qmax in the input boxes are valid
375        """
376        if self._data is None:
377            return False
378        qmin_valid = check_float(self._qmin_input)
379        qmax1_valid = check_float(self._qmax1_input)
380        qmax2_valid = check_float(self._qmax2_input)
381        qmax_valid = qmax1_valid and qmax2_valid
382        background_valid = check_float(self._background_input)
383        msg = ""
384        if (qmin_valid and qmax_valid and background_valid):
385            qmin = float(self._qmin_input.GetValue())
386            qmax1 = float(self._qmax1_input.GetValue())
387            qmax2 = float(self._qmax2_input.GetValue())
388            background = float(self._background_input.GetValue())
389            if not qmin > self._data.x.min():
390                msg = "qmin must be greater than the lowest q value"
391                qmin_valid = False
392            elif qmax2 < qmax1:
393                msg = "qmax1 must be less than qmax2"
394                qmax_valid = False
395            elif qmin > qmax1:
396                msg = "qmin must be less than qmax"
397                qmin_valid = False
398            elif background > self._data.y.max():
399                msg = "background must be less than highest I"
400                background_valid = False
401        if not qmin_valid:
402            self._qmin_input.SetBackgroundColour('pink')
403        if not qmax_valid:
404            self._qmax1_input.SetBackgroundColour('pink')
405            self._qmax2_input.SetBackgroundColour('pink')
406        if not background_valid:
407            self._background_input.SetBackgroundColour('pink')
408            if msg != "":
409                wx.PostEvent(self._manager.parent, StatusEvent(status=msg))
410        if (qmin_valid and qmax_valid and background_valid):
411            self._qmin_input.SetBackgroundColour(wx.WHITE)
412            self._qmax1_input.SetBackgroundColour(wx.WHITE)
413            self._qmax2_input.SetBackgroundColour(wx.WHITE)
414            self._background_input.SetBackgroundColour(wx.WHITE)
415        self._qmin_input.Refresh()
416        self._qmax1_input.Refresh()
417        self._qmax2_input.Refresh()
418        self._background_input.Refresh()
419        return (qmin_valid and qmax_valid and background_valid)
420
421    def _do_layout(self):
422        """
423        Draw the window content
424        """
425        vbox = wx.GridBagSizer(0,0)
426
427        # I(q) data box
428        databox = wx.StaticBox(self, -1, "I(Q) Data Source")
429        databox_sizer = wx.StaticBoxSizer(databox, wx.VERTICAL)
430
431        file_sizer = wx.GridBagSizer(5, 5)
432
433        file_name_label = wx.StaticText(self, -1, "Name:")
434        file_sizer.Add(file_name_label, (0, 0), (1, 1),
435            wx.LEFT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
436
437        self._data_name_box = OutputTextCtrl(self, -1,
438            size=(300,20))
439        file_sizer.Add(self._data_name_box, (0, 1), (1, 1),
440            wx.CENTER | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
441
442        file_sizer.AddSpacer((1, 25), pos=(0,2))
443        databox_sizer.Add(file_sizer, wx.TOP, 15)
444
445        vbox.Add(databox_sizer, (0, 0), (1, 1),
446            wx.LEFT | wx.RIGHT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE | wx.TOP, 15)
447
448
449        # Parameters
450        qbox = wx.StaticBox(self, -1, "Input Parameters")
451        qbox_sizer = wx.StaticBoxSizer(qbox, wx.VERTICAL)
452        qbox_sizer.SetMinSize((_STATICBOX_WIDTH, 75))
453
454        q_sizer = wx.GridBagSizer(5, 5)
455
456        # Explanation
457        explanation_txt = ("Corfunc will use all values in the lower range for"
458            " Guinier back extrapolation, and all values in the upper range "
459            "for Porod forward extrapolation.")
460        explanation_label = wx.StaticText(self, -1, explanation_txt,
461            size=(_STATICBOX_WIDTH, 60))
462
463        q_sizer.Add(explanation_label, (0,0), (1,4), wx.LEFT | wx.EXPAND, 5)
464
465        qrange_label = wx.StaticText(self, -1, "Q Range:", size=(50,20))
466        q_sizer.Add(qrange_label, (1,0), (1,1), wx.LEFT | wx.EXPAND, 5)
467
468        # Lower Q Range
469        qmin_label = wx.StaticText(self, -1, "Lower:", size=(50,20))
470        qmin_dash_label = wx.StaticText(self, -1, "-", size=(10,20),
471            style=wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL)
472
473        qmin_lower = OutputTextCtrl(self, -1, size=(75, 20), value="0.0")
474        self._qmin_input = ModelTextCtrl(self, -1, size=(75, 20),
475                        style=wx.TE_PROCESS_ENTER, name='qmin_input',
476                        text_enter_callback=self._on_enter_input)
477        self._qmin_input.SetToolTipString(("Values with q < qmin will be used "
478            "for Guinier back extrapolation"))
479
480        q_sizer.Add(qmin_label, (2, 0), (1, 1), wx.LEFT | wx.EXPAND, 5)
481        q_sizer.Add(qmin_lower, (2, 1), (1, 1), wx.LEFT, 5)
482        q_sizer.Add(qmin_dash_label, (2, 2), (1, 1), wx.CENTER | wx.EXPAND, 5)
483        q_sizer.Add(self._qmin_input, (2, 3), (1, 1), wx.LEFT, 5)
484
485        # Upper Q range
486        qmax_tooltip = ("Values with qmax1 < q < qmax2 will be used for Porod"
487            " forward extrapolation")
488
489        qmax_label = wx.StaticText(self, -1, "Upper:", size=(50,20))
490        qmax_dash_label = wx.StaticText(self, -1, "-", size=(10,20),
491            style=wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL)
492
493        self._qmax1_input = ModelTextCtrl(self, -1, size=(75, 20),
494            style=wx.TE_PROCESS_ENTER, name="qmax1_input",
495            text_enter_callback=self._on_enter_input)
496        self._qmax1_input.SetToolTipString(qmax_tooltip)
497        self._qmax2_input = ModelTextCtrl(self, -1, size=(75, 20),
498            style=wx.TE_PROCESS_ENTER, name="qmax2_input",
499            text_enter_callback=self._on_enter_input)
500        self._qmax2_input.SetToolTipString(qmax_tooltip)
501
502        q_sizer.Add(qmax_label, (3, 0), (1, 1), wx.LEFT | wx.EXPAND, 5)
503        q_sizer.Add(self._qmax1_input, (3, 1), (1, 1), wx.LEFT, 5)
504        q_sizer.Add(qmax_dash_label, (3, 2), (1, 1), wx.CENTER | wx.EXPAND, 5)
505        q_sizer.Add(self._qmax2_input, (3,3), (1, 1), wx.LEFT, 5)
506
507        background_label = wx.StaticText(self, -1, "Background:", size=(80,20))
508        q_sizer.Add(background_label, (4,0), (1,1), wx.LEFT | wx.EXPAND, 5)
509
510        self._background_input = ModelTextCtrl(self, -1, size=(75,20),
511            style=wx.TE_PROCESS_ENTER, name='background_input',
512            text_enter_callback=self._on_enter_input)
513        self._background_input.SetToolTipString(("A background value to "
514            "subtract from all intensity values"))
515        q_sizer.Add(self._background_input, (4,1), (1,1),
516            wx.RIGHT, 5)
517
518        background_button = wx.Button(self, wx.NewId(), "Calculate",
519            size=(75, 20))
520        background_button.Bind(wx.EVT_BUTTON, self._compute_background)
521        q_sizer.Add(background_button, (4, 2), (1, 1), wx.RIGHT, 5)
522
523        qbox_sizer.Add(q_sizer, wx.TOP, 0)
524
525        vbox.Add(qbox_sizer, (1, 0), (1, 1),
526            wx.LEFT | wx.RIGHT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
527
528        # Transform type
529        transform_box = wx.StaticBox(self, -1, "Transform Type")
530        transform_sizer = wx.StaticBoxSizer(transform_box, wx.VERTICAL)
531
532        radio_sizer = wx.GridBagSizer(5,5)
533
534        fourier_btn = wx.RadioButton(self, -1, "Fourier", name='fourier',
535            style=wx.RB_GROUP)
536        hilbert_btn = wx.RadioButton(self, -1, "Hilbert", name='hilbert')
537
538        fourier_btn.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.radio_changed)
539        hilbert_btn.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.radio_changed)
540
541        radio_sizer.Add(fourier_btn, (0,0), (1,1), wx.LEFT | wx.EXPAND)
542        radio_sizer.Add(hilbert_btn, (0,1), (1,1), wx.RIGHT | wx.EXPAND)
543
544        transform_sizer.Add(radio_sizer, wx.TOP, 0)
545        vbox.Add(transform_sizer, (2, 0), (1, 1),
546            wx.LEFT | wx.RIGHT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
547
548        # Output data
549        outputbox = wx.StaticBox(self, -1, "Output Parameters")
550        outputbox_sizer = wx.StaticBoxSizer(outputbox, wx.VERTICAL)
551
552        output_sizer = wx.GridBagSizer(5, 5)
553
554        self._output_boxes = dict()
555        i = 0
556        for key, value in OUTPUT_STRINGS.iteritems():
557            # Create a label and a text box for each poperty
558            label = wx.StaticText(self, -1, value)
559            output_box = OutputTextCtrl(self, wx.NewId(),
560                value="-", style=wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL)
561            # Save the ID of each of the text boxes for accessing after the
562            # output data has been calculated
563            self._output_boxes[key] = output_box
564            output_sizer.Add(label, (i, 0), (1, 1), wx.LEFT | wx.EXPAND, 15)
565            output_sizer.Add(output_box, (i, 2), (1, 1),
566                wx.RIGHT | wx.EXPAND, 15)
567            i += 1
568
569        outputbox_sizer.Add(output_sizer, wx.TOP, 0)
570
571        vbox.Add(outputbox_sizer, (3, 0), (1, 1),
572            wx.LEFT | wx.RIGHT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
573
574        # Controls
575        controlbox = wx.StaticBox(self, -1, "Controls")
576        controlbox_sizer = wx.StaticBoxSizer(controlbox, wx.VERTICAL)
577
578        controls_sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
579
580        extrapolate_btn = wx.Button(self, wx.NewId(), "Extrapolate")
581        self._transform_btn = wx.Button(self, wx.NewId(), "Transform")
582        self._extract_btn = wx.Button(self, wx.NewId(), "Compute Parameters")
583        help_btn = wx.Button(self, -1, "HELP")
584
585        self._transform_btn.Disable()
586        self._extract_btn.Disable()
587
588        extrapolate_btn.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.compute_extrapolation)
589        self._transform_btn.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.compute_transform)
590        self._extract_btn.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.extract_parameters)
591        help_btn.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.on_help)
592
593        controls_sizer.Add(extrapolate_btn, wx.CENTER | wx.EXPAND)
594        controls_sizer.Add(self._transform_btn, wx.CENTER | wx.EXPAND)
595        controls_sizer.Add(self._extract_btn, wx.CENTER | wx.EXPAND)
596        controls_sizer.Add(help_btn, wx.CENTER | wx.EXPAND)
597
598        controlbox_sizer.Add(controls_sizer, wx.TOP | wx.EXPAND, 0)
599        vbox.Add(controlbox_sizer, (4, 0), (1, 1),
600            wx.LEFT | wx.RIGHT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
601
602
603        self.SetSizer(vbox)
604
605    def _disable_inputs(self):
606        """
607        Disable all input fields
608        """
609        self._qmin_input.Disable()
610        self._qmax1_input.Disable()
611        self._qmax2_input.Disable()
612        self._background_input.Disable()
613
614    def _enable_inputs(self):
615        """
616        Enable all input fields
617        """
618        self._qmin_input.Enable()
619        self._qmax1_input.Enable()
620        self._qmax2_input.Enable()
621        self._background_input.Enable()
622
623    def _round_sig_figs(self, x, sigfigs):
624        """
625        Round a number to a given number of significant figures.
626
627        :param x: The value to round
628        :param sigfigs: How many significant figures to round to
629        :return rounded_str: x rounded to the given number of significant
630            figures, as a string
631        """
632        # Index of first significant digit
633        significant_digit = -int(np.floor(np.log10(np.abs(x))))
634        # Number of digits required for correct number of sig figs
635        digits = significant_digit + (sigfigs - 1)
636        rounded = np.round(x, decimals=digits)
637        rounded_str = "{1:.{0}f}".format(sigfigs -1  + significant_digit,
638            rounded)
639        return rounded_str
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.