source: sasview/src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_constants.py @ ad4632c

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since ad4632c was ad4632c, checked in by krzywon, 3 years ago

Save and load SESANS flag and zacceptance to/from project and analysis files.

  • Property mode set to 100644
File size: 20.2 KB
Line 
1"""
2Information relating to the CanSAS data format. These constants are used in
3the cansas_reader.py file to read in any version of the cansas format.
4"""
5class CansasConstants(object):
6    """
7    The base class to define where all of the data is to be saved by
8    cansas_reader.py.
9    """
10    names = ''
11    format = ''
12
13    def __init__(self):
14        self.names = self.CANSAS_NS
15        self.format = self.CANSAS_FORMAT
16
17    def iterate_namespace(self, namespace):
18        """
19        Method to iterate through a cansas constants tree based on a list of
20        names
21
22        :param namespace: A list of names that match the tree structure of
23            cansas_constants
24        """
25        # The current level to look through in cansas_constants.
26        return_me = CurrentLevel()
27        return_me.current_level = self.CANSAS_FORMAT.get("SASentry")
28        # Defaults for variable and datatype
29        return_me.ns_datatype = "content"
30        return_me.ns_optional = True
31        for name in namespace:
32            try:
33                if name != "SASentry":
34                    return_me.current_level = \
35                        return_me.current_level.get("children").get(name, "")
36                    if return_me.current_level == "":
37                        return_me.current_level = \
38                                return_me.current_level.get("<any>", "")
39                    cl_datatype = return_me.current_level.get("storeas", "")
40                    cl_units_optional = \
41                             return_me.current_level.get("units_optional", "")
42                    # Where are how to store the variable for the given
43                    # namespace CANSAS_CONSTANTS tree is hierarchical, so
44                    # is no value, inherit
45                    return_me.ns_datatype = cl_datatype if cl_datatype != "" \
46                        else return_me.ns_datatype
47                    return_me.ns_optional = cl_units_optional if \
48                        cl_units_optional != return_me.ns_optional \
49                                        else return_me.ns_optional
50            except AttributeError:
51                return_me.ns_datatype = "content"
52                return_me.ns_optional = True
53        return return_me
54
55    def get_namespace_map(self):
56        """
57        Helper method to get the names namespace list
58        """
59        return self.names
60
61    # CANSAS_NS holds the base namespace and default schema file information
62    CANSAS_NS = {"1.0" : {"ns" : "cansas1d/1.0",
63                          "schema" : "cansas1d_v1_0.xsd"
64                         },
65                 "1.1" : {"ns" : "urn:cansas1d:1.1",
66                          "schema" : "cansas1d_v1_1.xsd"
67                         }
68                }
69
70    # The constants below hold information on where to store the CanSAS data
71    # when loaded in using sasview
72    ANY = {"storeas" : "content"}
73    TITLE = {}
74    SASNOTE = {}
75    SASPROCESS_TERM = {"attributes" : {"unit" : {}, "name" : {}}}
76    SASPROCESS_SASPROCESSNOTE = {"children" : {"<any>" : ANY}}
77    SASPROCESS = {"children" : {"name" : {},
78                                "date" : {},
79                                "description" : {},
80                                "term" : SASPROCESS_TERM,
81                                "SASprocessnote" : SASPROCESS_SASPROCESSNOTE,
82                                "<any>" : ANY
83                               },
84                 }
85    RUN = {"attributes" : {"name" :{}}}
86    SASDATA_IDATA_Q = {"units_optional" : False,
87                       "storeas" : "float",
88                        "unit" : "x_unit",
89                       "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
90                      }
91    SASDATA_IDATA_I = {"units_optional" : False,
92                       "storeas" : "float",
93                        "unit" : "y_unit",
94                       "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
95                      }
96    SASDATA_IDATA_IDEV = {"units_optional" : False,
97                          "storeas" : "float",
98                          "unit" : "y_unit",
99                          "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
100                         }
101    SASDATA_IDATA_QDEV = {"units_optional" : False,
102                          "storeas" : "float",
103                          "unit" : "x_unit",
104                          "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
105                         }
106    SASDATA_IDATA_DQL = {"units_optional" : False,
107                         "storeas" : "float",
108                         "unit" : "x_unit",
109                         "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
110                        }
111    SASDATA_IDATA_DQW = {"units_optional" : False,
112                         "storeas" : "float",
113                         "unit" : "x_unit",
114                         "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}},
115                        }
116    SASDATA_IDATA_QMEAN = {"unit" : "x_unit",
117                           "attributes" : {"unit" : {}},
118                          }
119    SASDATA_IDATA_SHADOWFACTOR = {}
120    SASDATA_IDATA = {"attributes" : {"name" : {},"timestamp" : {"storeas" : "timestamp"}},
121                     "children" : {"Q" : SASDATA_IDATA_Q,
122                                   "I" : SASDATA_IDATA_I,
123                                   "Idev" : SASDATA_IDATA_IDEV,
124                                   "Qdev" : SASDATA_IDATA_QDEV,
125                                   "dQw" : SASDATA_IDATA_DQW,
126                                   "dQl" : SASDATA_IDATA_DQL,
127                                   "Qmean" : SASDATA_IDATA_QMEAN,
128                                   "Shadowfactor" : SASDATA_IDATA_SHADOWFACTOR,
129                                   "<any>" : ANY
130                                  }
131                    }
132    SASDATA = {"attributes" : {"name" : {}},
133               "variable" : None,
134               "children" : {"Idata" : SASDATA_IDATA,
135                             "Sesans": {"storeas": "content"},
136                             "zacceptance": {"storeas": "float"},
137                             "<any>" : ANY
138                            }
139              }
140    SASTRANSSPEC_TDATA_LAMDBA = {"storeas" : "float",
141                                 "unit" : "wavelength_unit",
142                                 "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}}
143                                }
144    SASTRANSSPEC_TDATA_T = {"storeas" : "float",
145                            "unit" : "transmission_unit",
146                            "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"}}
147                           }
148    SASTRANSSPEC_TDATA_TDEV = {"storeas" : "float",
149                               "unit" : "transmission_deviation_unit",
150                               "attributes" : {"unit" :{"storeas" : "content"}}
151                              }
152    SASTRANSSPEC_TDATA = {"children" : {"Lambda" : SASTRANSSPEC_TDATA_LAMDBA,
153                                        "T" : SASTRANSSPEC_TDATA_T,
154                                        "Tdev" : SASTRANSSPEC_TDATA_TDEV,
155                                        "<any>" : ANY,
156                                       }
157                         }
158    SASTRANSSPEC = {"children" : {"Tdata" : SASTRANSSPEC_TDATA,
159                                  "<any>" : ANY,
160                                 },
161                    "attributes" : {"name" :{}, "timestamp" : {},}
162                   }
163    SASSAMPLE_THICK = {"unit" : "thickness_unit",
164                       "storeas" : "float",
165                       "attributes" : {"unit" :{}},
166                      }
167    SASSAMPLE_TRANS = {"storeas" : "float",}
168    SASSAMPLE_TEMP = {"unit" : "temperature_unit",
169                      "storeas" : "float",
170                      "attributes" :{"unit" :{}},
171                     }
172    SASSAMPLE_POS_ATTR = {"unit" : {}}
173    SASSAMPLE_POS_X = {"unit" : "position_unit",
174                       "storeas" : "float",
175                       "attributes" : SASSAMPLE_POS_ATTR
176                      }
177    SASSAMPLE_POS_Y = {"unit" : "position_unit",
178                       "storeas" : "float",
179                       "attributes" : SASSAMPLE_POS_ATTR
180                      }
181    SASSAMPLE_POS_Z = {"unit" : "position_unit",
182                       "storeas" : "float",
183                       "attributes" : SASSAMPLE_POS_ATTR
184                      }
185    SASSAMPLE_POS = {"children" : {"x" : SASSAMPLE_POS_X,
186                                   "y" : SASSAMPLE_POS_Y,
187                                   "z" : SASSAMPLE_POS_Z,
188                                  },
189                    }
190    SASSAMPLE_ORIENT_ATTR = {"unit" :{}}
191    SASSAMPLE_ORIENT_ROLL = {"unit" : "orientation_unit",
192                             "storeas" : "float",
193                             "attributes" : SASSAMPLE_ORIENT_ATTR
194                            }
195    SASSAMPLE_ORIENT_PITCH = {"unit" : "orientation_unit",
196                              "storeas" : "float",
197                              "attributes" : SASSAMPLE_ORIENT_ATTR
198                             }
199    SASSAMPLE_ORIENT_YAW = {"unit" : "orientation_unit",
200                            "storeas" : "float",
201                            "attributes" : SASSAMPLE_ORIENT_ATTR
202                           }
203    SASSAMPLE_ORIENT = {"children" : {"roll" : SASSAMPLE_ORIENT_ROLL,
204                                      "pitch" : SASSAMPLE_ORIENT_PITCH,
205                                      "yaw" : SASSAMPLE_ORIENT_YAW,
206                                     },
207                       }
208    SASSAMPLE = {"attributes" :
209                 {"name" : {},},
210                 "children" : {"ID" : {},
211                               "thickness" : SASSAMPLE_THICK,
212                               "transmission" : SASSAMPLE_TRANS,
213                               "temperature" : SASSAMPLE_TEMP,
214                               "position" : SASSAMPLE_POS,
215                               "orientation" : SASSAMPLE_ORIENT,
216                               "details" : {},
217                               "<any>" : ANY
218                              },
219                }
220    SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_ATTR = {"unit" : ""}
221    SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_X = {"unit" : "beam_size_unit",
222                               "storeas" : "float",
223                               "attributes" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_ATTR
224                              }
225    SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_Y = {"unit" : "beam_size_unit",
226                               "storeas" : "float",
227                               "attributes" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_ATTR
228                              }
229    SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_Z = {"unit" : "beam_size_unit",
230                               "storeas" : "float",
231                               "attributes" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_ATTR
232                              }
233    SASINSTR_SRC_BEAMSIZE = {"attributes" : {"name" : {}},
234                             "children" : {"x" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_X,
235                                           "y" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_Y,
236                                           "z" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE_Z,
237                                          }
238                            }
239    SASINSTR_SRC_WL = {"unit" : "wavelength_unit",
240                       "storeas" : "float",
241                       "attributes" : {"unit" :{},
242                       }
243                      }
244    SASINSTR_SRC_WL_MIN = {"unit" : "wavelength_min_unit",
245                           "storeas" : "float",
246                           "attributes" : {"unit" :{"storeas" : "content"},}
247                          }
248    SASINSTR_SRC_WL_MAX = {"unit" : "wavelength_max_unit",
249                           "storeas" : "float",
250                           "attributes" : {"unit" :{"storeas" : "content"},}
251                          }
252    SASINSTR_SRC_WL_SPR = {"unit" : "wavelength_spread_unit",
253                           "storeas" : "float",
254                           "attributes" : {"unit" : {"storeas" : "content"},}
255                          }
256    SASINSTR_SRC = {"attributes" : {"name" : {}},
257                    "children" : {"radiation" : {},
258                                  "beam_size" : SASINSTR_SRC_BEAMSIZE,
259                                  "beam_shape" : {},
260                                  "wavelength" : SASINSTR_SRC_WL,
261                                  "wavelength_min" : SASINSTR_SRC_WL_MIN,
262                                  "wavelength_max" : SASINSTR_SRC_WL_MAX,
263                                  "wavelength_spread" : SASINSTR_SRC_WL_SPR,
264                                 },
265                   }
266    SASINSTR_COLL_APER_ATTR = {"unit" : {}}
267    SASINSTR_COLL_APER_X = {"unit" : "size_unit",
268                            "storeas" : "float",
269                            "attributes" : SASINSTR_COLL_APER_ATTR
270                           }
271    SASINSTR_COLL_APER_Y = {"unit" : "size_unit",
272                            "storeas" : "float",
273                            "attributes" : SASINSTR_COLL_APER_ATTR
274                           }
275    SASINSTR_COLL_APER_Z = {"unit" : "size_unit",
276                            "storeas" : "float",
277                            "attributes" : SASINSTR_COLL_APER_ATTR
278                           }
279    SASINSTR_COLL_APER_SIZE = {"attributes" : {"unit" : {}},
280                               "children" : {"storeas" : "float",
281                                             "x" : SASINSTR_COLL_APER_X,
282                                             "y" : SASINSTR_COLL_APER_Y,
283                                             "z" : SASINSTR_COLL_APER_Z,
284                                            }
285                              }
286    SASINSTR_COLL_APER_DIST = {"storeas" : "float",
287                               "attributes" : {"unit" : {}},
288                               "unit" : "distance_unit",
289                              }
290    SASINSTR_COLL_APER = {"attributes" : {"name" : {}, "type" : {}, },
291                          "children" : {"size" : SASINSTR_COLL_APER_SIZE,
292                                        "distance" : SASINSTR_COLL_APER_DIST
293                                       }
294                         }
295    SASINSTR_COLL = {"attributes" : {"name" : {}},
296                     "children" :
297                         {"length" :
298                          {"unit" : "length_unit",
299                           "storeas" : "float",
300                           "attributes" : {"storeas" : "content", "unit" : {}},
301                          },
302                          "aperture" : SASINSTR_COLL_APER,
303                         },
304                    }
305    SASINSTR_DET_SDD = {"storeas" : "float",
306                        "unit" : "distance_unit",
307                        "attributes" : {"unit" :{}},
308                       }
309    SASINSTR_DET_OFF_ATTR = {"unit" : {"storeas" : "content" }}
310    SASINSTR_DET_OFF_X = {"storeas" : "float",
311                          "unit" : "offset_unit",
312                          "attributes" : SASINSTR_DET_OFF_ATTR
313                         }
314    SASINSTR_DET_OFF_Y = {"storeas" : "float",
315                          "unit" : "offset_unit",
316                          "attributes" : SASINSTR_DET_OFF_ATTR
317                         }
318    SASINSTR_DET_OFF_Z = {"storeas" : "float",
319                          "unit" : "offset_unit",
320                          "attributes" : SASINSTR_DET_OFF_ATTR
321                         }
322    SASINSTR_DET_OFF = {"children" : {"x" : SASINSTR_DET_OFF_X,
323                                      "y" : SASINSTR_DET_OFF_Y,
324                                      "z" : SASINSTR_DET_OFF_Z,
325                                     }
326                       }
327    SASINSTR_DET_OR_ATTR = {}
328    SASINSTR_DET_OR_ROLL = {"storeas" : "float",
329                            "unit" : "orientation_unit",
330                            "attributes" : SASINSTR_DET_OR_ATTR
331                           }
332    SASINSTR_DET_OR_PITCH = {"storeas" : "float",
333                             "unit" : "orientation_unit",
334                             "attributes" : SASINSTR_DET_OR_ATTR
335                            }
336    SASINSTR_DET_OR_YAW = {"storeas" : "float",
337                           "unit" : "orientation_unit",
338                           "attributes" : SASINSTR_DET_OR_ATTR
339                          }
340    SASINSTR_DET_OR = {"children" : {"roll" : SASINSTR_DET_OR_ROLL,
341                                     "pitch" : SASINSTR_DET_OR_PITCH,
342                                     "yaw" : SASINSTR_DET_OR_YAW,
343                                    }
344                      }
345    SASINSTR_DET_BC_X = {"storeas" : "float",
346                         "unit" : "beam_center_unit",
347                         "attributes" : {"storeas" : "content"}
348                        }
349    SASINSTR_DET_BC_Y = {"storeas" : "float",
350                         "unit" : "beam_center_unit",
351                         "attributes" : {"storeas" : "content"}
352                        }
353    SASINSTR_DET_BC_Z = {"storeas" : "float",
354                         "unit" : "beam_center_unit",
355                         "attributes" : {"storeas" : "content"}
356                        }
357    SASINSTR_DET_BC = {"children" : {"x" : SASINSTR_DET_BC_X,
358                                     "y" : SASINSTR_DET_BC_Y,
359                                     "z" : SASINSTR_DET_BC_Z,}
360                      }
361    SASINSTR_DET_PIXEL_X = {"storeas" : "float",
362                            "unit" : "pixel_size_unit",
363                            "attributes" : {"storeas" : "content" }
364                           }
365    SASINSTR_DET_PIXEL_Y = {"storeas" : "float",
366                            "unit" : "pixel_size_unit",
367                            "attributes" : {"storeas" : "content"}
368                           }
369    SASINSTR_DET_PIXEL_Z = {"storeas" : "float",
370                            "unit" : "pixel_size_unit",
371                            "attributes" : {"storeas" : "content"}
372                           }
373    SASINSTR_DET_PIXEL = {"children" : {"x" : SASINSTR_DET_PIXEL_X,
374                                        "y" : SASINSTR_DET_PIXEL_Y,
375                                        "z" : SASINSTR_DET_PIXEL_Z,
376                                       }
377                         }
378    SASINSTR_DET_SLIT = {"storeas" : "float",
379                         "unit" : "slit_length_unit",
380                         "attributes" : {"unit" : {}}
381                        }
382    SASINSTR_DET = {"attributes" : {"name" : {"storeas" : "content"}},
383                    "children" : {"name" : {"storeas" : "content"},
384                                  "SDD" : SASINSTR_DET_SDD,
385                                  "offset" : SASINSTR_DET_OFF,
386                                  "orientation" : SASINSTR_DET_OR,
387                                  "beam_center" : SASINSTR_DET_BC,
388                                  "pixel_size" : SASINSTR_DET_PIXEL,
389                                  "slit_length" : SASINSTR_DET_SLIT,
390                                 }
391                   }
392    SASINSTR = {"children" :
393                {"name" : {},
394                 "SASsource" : SASINSTR_SRC,
395                 "SAScollimation" : SASINSTR_COLL,
396                 "SASdetector" : SASINSTR_DET,
397                },
398               }
399    CANSAS_FORMAT = {"SASentry" :
400                     {"units_optional" : True,
401                      "storeas" : "content",
402                      "attributes" : {"name" : {}},
403                      "children" : {"Title" : TITLE,
404                                    "Run" : RUN,
405                                    "SASdata" : SASDATA,
406                                    "SAStransmission_spectrum" : SASTRANSSPEC,
407                                    "SASsample" : SASSAMPLE,
408                                    "SASinstrument" : SASINSTR,
409                                    "SASprocess" : SASPROCESS,
410                                    "SASnote" : SASNOTE,
411                                    "<any>" : ANY,
412                                   }
413                     }
414                    }
415
416
417class CurrentLevel(object):
418    """
419    A helper class to hold information on where you are in the constants tree
420    """
421
422    current_level = ''
423    ns_datatype = ''
424    ns_optional = True
425
426    def __init__(self):
427        self.current_level = {}
428        self.ns_datatype = "content"
429        self.ns_optional = True
430
431    def get_current_level(self):
432        """
433        Helper method to get the current_level map
434        """
435        return self.current_level
436
437    def get_data_type(self):
438        """
439        Helper method to get the ns_datatype label
440        """
441        return self.ns_datatype
442
443    def get_variable(self):
444        """
445        Helper method to get the ns_variable label
446        """
447        return self.ns_variable
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.