source: sasview/DataLoader/readers/hfir1d_reader.py @ fe9c19b4

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since fe9c19b4 was fe78c7b, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 15 years ago

DataLoader?: exception no longer raised when units are wrong for an entry; the entry is not loaded and an error is logged instead. Loader info is now stored.

  • Property mode set to 100644
File size: 5.0 KB
Line 
1"""
2This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4project funded by the US National Science Foundation.
5
6See the license text in license.txt
7
8copyright 2008, University of Tennessee
9"""
10
11import numpy
12import os
13from DataLoader.data_info import Data1D
14
15# Check whether we have a converter available
16has_converter = True
17try:
18    from data_util.nxsunit import Converter
19except:
20    has_converter = False
21
22class Reader(object):
23    """
24        Class to load HFIR 1D 4-column files
25    """
26    ## File type
27    type_name = "HFIR 1D"   
28    ## Wildcards
29    type = ["HFIR 1D files (*.d1d)|*.d1d"]
30    ## List of allowed extensions
31    ext=['.d1d'] 
32   
33    def read(self, path):
34        """
35            Load data file
36           
37            @param path: file path
38            @return: Data1D object, or None
39            @raise RuntimeError: when the file can't be opened
40            @raise ValueError: when the length of the data vectors are inconsistent
41        """
42        if os.path.isfile(path):
43            basename  = os.path.basename(path)
44            root, extension = os.path.splitext(basename)
45            if extension.lower() in self.ext:
46                try:
47                    input_f =  open(path,'r')
48                except :
49                    raise  RuntimeError, "hfir1d_reader: cannot open %s" % path
50                buff = input_f.read()
51                lines = buff.split('\n')
52                x  = numpy.zeros(0)
53                y  = numpy.zeros(0)
54                dx = numpy.zeros(0)
55                dy = numpy.zeros(0)
56                output = Data1D(x, y, dx=dx, dy=dy)
57                self.filename = output.filename = basename
58           
59                data_conv_q = None
60                data_conv_i = None
61               
62                if has_converter == True and output.x_unit != '1/A':
63                    data_conv_q = Converter('1/A')
64                    # Test it
65                    data_conv_q(1.0, output.x_unit)
66                   
67                if has_converter == True and output.y_unit != '1/cm':
68                    data_conv_i = Converter('1/cm')
69                    # Test it
70                    data_conv_i(1.0, output.y_unit)
71                           
72                for line in lines:
73                    toks = line.split()
74                    try:
75                        _x = float(toks[0])
76                        _y = float(toks[1])
77                        _dx = float(toks[3])
78                        _dy = float(toks[2])
79                       
80                        if data_conv_q is not None:
81                            _x = data_conv_q(_x, units=output.x_unit)
82                            _dx = data_conv_q(_dx, units=output.x_unit)
83                           
84                        if data_conv_i is not None:
85                            _y = data_conv_i(_y, units=output.y_unit)                       
86                            _dy = data_conv_i(_dy, units=output.y_unit)                       
87                                                   
88
89                        x   = numpy.append(x, _x) 
90                        y   = numpy.append(y, _y)
91                        dx  = numpy.append(dx, _dx)
92                        dy  = numpy.append(dy, _dy)                       
93                    except:
94                        # Couldn't parse this line, skip it
95                        pass
96                         
97                     
98                # Sanity check
99                if not len(y) == len(dy):
100                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: y and dy have different length"
101                if not len(x) == len(dx):
102                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: x and dx have different length"
103
104                # If the data length is zero, consider this as
105                # though we were not able to read the file.
106                if len(x)==0:
107                    raise RuntimeError, "hfir1d_reader: could not load file"
108               
109                output.x = x
110                output.y = y
111                output.dy = dy
112                output.dx = dx
113                if data_conv_q is not None:
114                    output.xaxis("\\rm{Q}", output.x_unit)
115                else:
116                    output.xaxis("\\rm{Q}", 'A^{-1}')
117                if data_conv_i is not None:
118                    output.yaxis("\\rm{Intensity}", output.y_unit)
119                else:
120                    output.yaxis("\\rm{Intensity}","cm^{-1}")
121               
122                # Store loading process information
123                output.meta_data['loader'] = self.type_name   
124                return output
125        else:
126            raise RuntimeError, "%s is not a file" % path
127        return None
128   
129if __name__ == "__main__": 
130    reader = Reader()
131    print reader.read("../test/S2-30dq.d1d")
132   
133   
134                       
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.